Евразийский банк развития • ЕАБР
01
Доступная чистая вода и энергия
02
Развитие дорожно-транспортной инфраструктуры
03
Продовольственная безопасность
04
Повышение конкурентоспособности несырьевого экспорта
05
Создание альтернативных возобновляемых источников энергии
06
Внедрение наилучших доступных технологий
Текущие проекты
Все проекты
Ваши возможности
c ЕАБР
получить финансирование
инвестировать в развитие
запросить техническое содействие
Новости
ЕАБР получил премию ADFIAP Sustainable Awards 2022 за приложение «Путешествую без COVID-19»
Совместные проекты в Центральной Азии и исследования: ЕАБР и АБР обсудили развитие сотрудничества
Исследование ЕАБР: Роль международного транспортного коридора «Север — Юг» существенно возрастает в условиях новой логистики
Тигран Саркисян: В ЕАЭС надо совместно идти по пути регулирования искусственного интеллекта
Все новости
Макроэкономические прогнозы
Макроэкономические обзоры
Специальные доклады
Подробнее
Объем инвестиционного
портфеля
Годовой отчет Стратегия
Стратегии 20182019202120266.1млрд $7.4млрд $11.3млрд $22.2инвестиции в ключевые проектыпроекты в странахс малыми экономикамицифровые проектыинвестициив новые проектымлрд $1.2млрд $0.5млрд $0.1млрд $9.17.4млрд $22.2+ ++++Страны участники
Армения
Беларусь
Казахстан
Кыргызстан
Россия
Таджикистан
Для стран ЕАЭС могут ввести отдельные адреса сайтов «.
еа» | СтатьиДля государств — участников Евразийского экономического союза (ЕАЭС), в который входят Россия, Казахстан и Белоруссия (в дальнейшем к нему могут присоединиться Армения и Киргизия), рассматривают возможность регистрации единого географического домена верхнего уровня — «.ea». Об этом сообщил директор департамента информационных технологий Евразийской экономической комиссии Александр Хотько. По его словам, комиссия после вступления в силу Договора о Евразийском экономическом союзе планирует обратиться в Корпорацию интернета по распределению имен и адресов (Internet Corporation for Assigned Names and Numbers (далее — ICANN)) по вопросу создания домена «.ea» либо других похожих свободных двухбуквенных доменов.
Согласно правилам ICANN, которая регулирует вопросы регистрации доменов верхнего уровня, для регистрации адреса сайтов необходимо, чтобы в международном стандарте ISO 3166, определяющем кодовые обозначения государств и зависимых территорий, за Евразийским экономическим союзом был закреплен отдельный двухбуквенный код.
«Проведенный анализ показал, что в настоящее время код EA в классификаторе зарезервирован для ограниченного использования за заморской территорией Испании в Африке. Вместе с тем соответствующего кода EA в классификаторе домена .EA на сегодняшний день не существует», — сообщается в ответе Хотько на имя депутата Госдумы Игоря Зотова.
Хотько пояснил, что инициация мероприятий по внесению изменений в международный стандарт ISO-3166 может быть начата не ранее вступления в силу Договора о Евразийском экономическом союзе от 29 мая 2014 года. По его словам, как правило, подготовка и внесение изменений в указанный международный стандарт является длительной процедурой и может растянуться на 2–3 года.
Кроме того, он отметил, что комиссией прорабатывался вопрос возможности регистрации домена верхнего уровня для ЕАЭС в рамках программы создания новых доменов New gTLD (регистрируются адреса, содержащие 3 и более символов, например, EEU). Однако в настоящее время прием заявок на регистрацию таких доменов не проводится, а о сроках открытия следующих этапов приема заявок ICANN официально не сообщала.
По неофициальной информации, новый этап сбора заявок может начаться в 2015–2017 годах.
Напомним, что с предложением зарегистрировать отдельный домен для стран ЕАЭС в июле 2014 года к председателю Коллегии Евразийской экономической комиссии Виктору Христенко обратился депутат Госдумы, лидер Российской партии пенсионеров за справедливость Игорь Зотов. По словам парламентария, использование домена «.ea» будет способствовать не только дальнейшей интеграции и культивированию евразийских ценностей в обществе, но и позволит улучшить взаимодействие информационных сетей на евразийском пространстве. Предполагается, что право регистрировать доменные имена более низкого уровня в домене «.ea» получат граждане и организации, зарегистрированные на территории государств-участников зарождающегося Евразийского экономического союза.
Кроме того, в своем письме Зотов подчеркнул, что, выступая на медиафоруме независимых региональных и местных средств массовой информации «Правда и справедливость», президент Владимир Путин отметил необходимость размещения серверов крупнейших национальных интернет-ресурсов на территории нашей страны с целью защиты информации.
Ранее аналогичное письмо было направлено в администрацию президента на рассмотрение. Помощник президента Игорь Щеголев сообщил, что введение единого географического домена Союза будет способствовать более динамичному и эффективному развитию интеграционных процессов государств — членов Союза и станет важным элементом международного позиционирования евразийского интеграционного процесса. Щеголев отметил, что решение о регистрации доменов верхнего уровня принимает ICANN, поэтому в соответствии с установленным порядком для регистрации «.ea» требуется согласие государств — членов ЕАЭС и определение организации, ответственной за администрирование и поддержку доменной зоны.
Первый зампред комитета ГД по информполитике Вадим Деньгин считает, что такую доменную зону необходимо создавать в ближайшее время, однако, по его словам, в условиях информационной войны могут быть провокации.
— Это для ЕАЭС не помешает. Любое расширение в интернете приветствуется. Но нужно помнить, что в условиях информационной войны каждый пытается ставить преграды и уязвить Россию.
В системе координат, я уверен, будут какие-то поползновения и выпады в сторону доменной зоны, чтобы оболгать и унизить. Россия сейчас укрепляется вместе с соседями и друзьями. Уверен, что провокации будут, — говорит он. — Раз уж пытаются закрыть систему международных банковских расчетов SWIFT в России, то определенно стоит ожидать нападок при появлении такой мощной доменной зоны. Делать ее нужно в самое ближайшее время, чтобы она в течение года набрала тот формат адресов, которые будут знать все граждане нашей страны, и это войдет в обиход каждого гражданина — что есть .ru, «.рф», «.ea».
В свою очередь, интернет-эксперт Антон Меркуров ставит под сомнение необходимость создания новой доменной зоны.
— Технологически такая регистрация занимает пять минут, подготовка бумаг для того, чтобы завести новую доменную зону, занимает от месяца до полугода. Смысла новый домен как таковой не имеет, потому что домены в какой-то обозримой перспективе отомрут и обесценятся, — добавил он.
Новое определение энтероагрегационной кишечной палочки (EAEC): геномная характеристика эпидемиологических штаммов EAEC
1. Океке И.Н., Ламиканра А., Штайнрюк Х., Капер Дж.Б. Характеристика штаммов Escherichia coli в случаях детской диареи в юго-западной провинции Нигерии. Дж. Клин Микробиол. 2000; 38: 7–12. Доступно: http://www.pubmedcentral.nih.gov/articlerender.fcgi?artid=86005&tool=pmcentrez&rendertype=abstract [бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar]
2. Valentiner-Branth P, Steinsland H, Fischer Т.К., Окунь М., Шойц Ф., Диас Ф. и др. Когортное исследование гвинейских детей: заболеваемость, патогенность, обеспечиваемая защита и атрибутивный риск заражения энтеропатогенами в течение первых 2 лет жизни. Дж. Клин Микробиол. 2003; 41: 4238–45. Доступно: http://www.pubmedcentral.nih.gov/articlerender.fcgi?artid=19.3811&tool=pmcentrez&rendertype=abstract [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar]
3. Rogawski ET, Guerrant RL, Havt A, Lima IFN, Medeiros PHQS, Seidman JC, et al.
Эпидемиология энтероагрегативной инфекции Escherichia coli и связанные с ней исходы в когорте новорожденных MAL-ED.
PLoS Negl Trop Dis.
2017;11
10.1371/journal.pntd.0005798 [бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
4. Scheutz F, Nielsen EM, Frimodt-Møller J, Boisen N, Morabito S, Tozzoli R, et al. Характеристики штамма Escherichia coli O104:h5, продуцирующего энтероагрегативный шига-токсин/веротоксин, вызвавшего вспышку гемолитико-уремического синдрома в Германии, с мая по июнь 2011 г. Евронаблюдение. 2011;16 Доступно: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/2169.9770 [PubMed] [Google Scholar]
5. Nataro JP, Kaper JB, Robins-Browne R, Prado V, Vial P, Levine MM. Закономерности прикрепления диареегенной кишечной палочки к клеткам HEp-2. Pediatr Infect Dis J. 1987; 6: 829–31. Доступно: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/3313248 [PubMed] [Google Scholar]
6. Boisen N, Hansen A-M, Melton-Celsa AR, Zangari T, Mortensen NP, Kaper JB, и другие.
Присутствие плазмиды pAA в немецком O104:h5 шига-токсине типа 2a (Stx2a), продуцирующем энтероагрегативный штамм Escherichia coli, способствует транслокации Stx2a через монослой эпителиальных клеток.
J заразить Dis. 2014. [по состоянию на 15 ноября 2014 г.]. 10.1093/infdis/jiu399 [бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
7. Boisen N, Scheutz F, Rasko D, Redman JC, Persson S, Simon J, et al. Геномная характеристика энтероагрегационной кишечной палочки у детей в Мали. J заразить Dis. 2012; 205: 431–44. 10.1093/infdis/jir757 [бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
8. Lima IFN, Boisen N, Quetz J da S, Havt A, de Carvalho EB, Soares AM, et al. Распространенность энтероагрегативной кишечной палочки и генов, связанных с ее вирулентностью, в исследовании случай-контроль среди детей из северо-восточной Бразилии. J Med Microbiol. 2013; 62: 683–69.3. 10.1099/jmm.0.054262–0 [бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
9. Океке И.Н., Ламиканра А., Чечулин Дж., Дубовский Ф., Капер Дж.Б., Натаро Дж.П. Гетерогенная вирулентность энтероагрегативных штаммов кишечной палочки, выделенных от детей на юго-западе Нигерии. J заразить Dis.
10. Boisen N, Ruiz-Perez F, Scheutz F, Krogfelt KA, Nataro JP. Краткий отчет: высокая распространенность аутотранспортерных цитотоксинов сериновых протеаз среди штаммов энтероагрегативной кишечной палочки. Am J Trop Med Hyg. 2009 г.;80: 294–301. Доступно: http://www.pubmedcentral.nih.gov/articlerender.fcgi?artid=2660206&tool=pmcentrez&rendertype=abstract [бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar]
11. Jenkins C, van Ijperen C, Dudley EG , Chart H, Willshaw GA, Cheasty T, et al. Использование микрочипа для оценки распределения плазмидных и хромосомных генов вирулентности в штаммах энтероагрегативной кишечной палочки. FEMS Microbiol Lett. 2005; 253: 119–24. 10.1016/j.femsle.2005.09.040 [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
12. Nataro JP, Yikang D, Yingkang D, Walker K. AggR, транскрипционный активатор экспрессии фимбрии агрегации адгезии I в энтероагрегативной Escherichia coli. J Бактериол.
1994; 176: 4691–9. Доступно: http://www.pubmedcentral.nih.gov/articlerender.fcgi?artid=196291&tool=pmcentrez&rendertype=abstract [бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar]
13. Бернье С., Гунон П., Ле Бугенек С. , Идентификация оперона, кодирующего агрегационную адгезивную фимбрию (AAF) типа III, в энтероагрегативной Escherichia coli в качестве чувствительного зонда для обнаружения семейства оперонов, кодирующего AAF. Заразить иммун. 2002; 70: 4302–11. Доступно: http://www.pubmedcentral.nih.gov/articlerender.fcgi?artid=128174&tool=pmcentrez&rendertype=abstract [бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar]
14. Boisen N, Struve C, Scheutz F, Krogfelt KA, Nataro JP. Новый адгезин энтероагрегационной кишечной палочки, относящейся к семейству Afa/Dr/AAF. Заразить иммун. 2008; 76: 3281–92. 10.1128/IAI.01646-07 [бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
15. Чечулин Дж. Р., Балепур С., Хикс С., Филлипс А., Холл Р., Котари М. Х. и др.
Агрегативная адгезия fimbria II, второй фимбриальный антиген, опосредующий агрегационную адгезию у энтероагрегационной Escherichia coli.
Заразить иммун. 1997;65: 4135–45. Доступно: http://www.pubmedcentral.nih.gov/articlerender.fcgi?artid=175595&tool=pmcentrez&rendertype=abstract [бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar]
16. Henderson IR, Hicks S, Navarro-Garcia Ф., Элиас В.П., Филипс А.Д., Натаро Дж.П. Участие энтероагрегативного токсина, кодируемого плазмидой Escherichia coli, в повреждении кишечника человека. Заразить иммун. 1999; 67: 5338–44. Доступно: http://www.pubmedcentral.nih.gov/articlerender.fcgi?artid=96889&tool=pmcentrez&rendertype=abstract [бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar]
17. Nataro JP, Yikang D, Giron JA, Savarino SJ, Kothary MH, Hall R. Экспрессия фимбрии агрегации адгезии I в энтероагрегативной Escherichia coli требует двух несвязанных плазмидных областей. Заразить иммун. 1993; 61: 1126–31. Доступно: http://www.pubmedcentral.nih.gov/articlerender.fcgi?artid=302849&tool=pmcentrez&rendertype=abstract [бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar]
18. Jønsson R, Struve C, Boisen N, Матейу Р.
В., Сантьяго А.Е., Дженссен Х. и др.
Новая фимбрия агрегации адгезии (AAF/V) энтероагрегационной кишечной палочки (EAEC).
Заразить иммун. 2015. [по состоянию на 15 февраля 2015 г.]. 10.1128/IAI.02820-14 [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
19. Пул Н.М., Раджан А., Марессо А.В. Кишечные энтероиды человека для изучения бактериальной адгезии, инвазии и транслокации. Курр Проток Микробиол. 2018;50: е55 10.1002/cpmc.55 [бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
20. Strauman MC, Harper JM, Harrington SM, Boll EJ, Nataro JP. Энтероагрегативная кишечная палочка разрушает плотные контакты эпителиальных клеток. Заразить иммун. 2010;78: 4958–64. 10.1128/IAI.00580-10 [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
21. Harrington SM, Strauman MC, Abe CM, Nataro JP. Агрегатные адгезионные фимбрии способствуют воспалительной реакции эпителиальных клеток, инфицированных энтероагрегативной кишечной палочкой. Клеточная микробиология.
2005;7: 1565–1578. 10.1111/j.1462-5822.2005.00588.x [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
22. Сантьяго А.Е., Руис-Перес Ф., Джо Н.Ю., Виджаякумар В., Гонг М.К., Натаро Дж.П. Большое семейство регуляторов антивирулентности модулирует эффекты активаторов транскрипции у грамотрицательных патогенных бактерий. PLoS Патог. 2014;10: e1004153 10.1371/journal.ppat.1004153 [бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
23. Дадли Э.Г., Томсон Н.Р., Паркхилл Дж., Морин Н.П., Натаро Дж.П. Протеомная и микрочиповая характеристика регулона AggR идентифицирует остров патогенности pheU в энтероагрегативной кишечной палочке. Мол микробиол. 2006; 61: 1267–82. 10.1111/j.1365-2958.2006.05281.x [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
24. Dutta PR, Cappello R, Navarro-García F, Nataro JP. Функциональное сравнение аутотранспортеров сериновых протеаз энтеробактерий. Заразить иммун. 2002; 70: 7105–13. Доступно: http://www.pubmedcentral.nih.gov/articlerender.fcgi?artid=133081&tool=pmcentrez&rendertype=abstract [бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar]
25.
Ikumapayi UN, Boisen N, Hossain MJ, Betts M, Lamin M, Saha D, et al.
Выявление субпопуляций энтероагрегационной кишечной палочки, ассоциированной с диарейными заболеваниями, среди детей в возрасте до 5 лет из сельской Гамбии. Am J Trop Med Hyg. 2017;97
10.4269/ajtmh.16-0705 [бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
26. Sarantuya J, Nishi J, Wakimoto N, Erdene S, Nataro JP, Sheikh J, et al. Типичная энтероагрегатная кишечная палочка является наиболее распространенным патотипом среди штаммов кишечной палочки, вызывающих диарею у монгольских детей. Дж. Клин Микробиол. 2004; 42: 133–9.. Доступно: http://www.pubmedcentral.nih.gov/articlerender.fcgi?artid=321701&tool=pmcentrez&rendertype=abstract [бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar]
27. Kotloff KL, Nataro JP, Blackwelder WC, Насрин Д., Фараг Т.Х., Панчалингам С. и др.
Бремя и этиология диарейных заболеваний у младенцев и детей младшего возраста в развивающихся странах (Глобальное многоцентровое исследование кишечных инфекций, GEMS): проспективное исследование случай-контроль.
Ланцет. 2013; 382: 209–22. 10.1016/S0140-6736(13)60844-2 [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
28. Noel G, Baetz NW, Staab JF, Donowitz M, Kovbasnjuk O, Pasetti MF, et al. Первичная модель совместного культивирования макрофагов и энтероидов человека для исследования физиологии слизистой оболочки кишечника и взаимодействия хозяина и патогена. Научный представитель 2017;7 10.1038/srep45270 [PMC free article] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
29. Орсков Ф., Орсков И. Серотипирование кишечной палочки и заболевания человека и животных. Может J Microbiol. 1992; 38: 699–704. Доступно: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/1382824 [PubMed] [Google Scholar]
30. Roer L, Overballe-Petersen S, Hansen F, Johannesen TB, Stegger M, Bortolaia V, et al.
Изолят ST131 fimh32 Escherichia coli с плазмидой blaCMY-2/IncI1/ST12, полученный от пациента с инфекцией кровотока: очень похож на изоляты E. coli бройлерного происхождения. J Антимикробная химиотерапия. 2019; 74: 557–560. 10.
1093/jac/dky484 [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
31. Wick RR, Judd LM, Gorrie CL, Holt KE. Завершение сборки бактериального генома с помощью мультиплексного секвенирования MinION. Геномика микробов. 2017;3: e000132 10.1099/mgen.0.000132 [бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
32. Bolger AM, Lohse M, Usadel B. Trimmomatic: гибкий триммер для данных последовательности Illumina. Биоинформатика. 2014;30: 2114–20. 10.1093/bioinformatics/btu170 [бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
33. Wick RR, Judd LM, Gorrie CL, Holt KE. Unicycler: разрешение сборок бактериального генома из коротких и длинных ридов секвенирования. Филиппи А.М., редактор. PLOS Comput Biol. 2017;13: e1005595 10.1371/journal.pcbi.1005595 [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
34. Sahl JW, Beckstrom-Sternberg SM, Babic-Sternberg JS, Gillece JD, Hepp CM, Auerbach RK, et al.
In Silico Genotyper (ISG): конвейер с открытым исходным кодом для быстрой идентификации и аннотирования вариантов нуклеотидов для приложений сравнительной геномики.
bioRxiv. 2015 г.; 015578
10.1101/015578 [CrossRef] [Google Scholar]
35. Сахл Дж. В., Капорасо Дж. Г., Раско Д. А., Кейм П. Конвейер крупномасштабного коэффициента оценки взрыва (LS-BSR): метод быстрого сравнения генетического содержимого между бактериальными геномами. . Пир Дж. 2014;2: е332 10.7717/peerj.332 [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
36. Joensen KG, Tetzschner AMM, Iguchi A, Aarestrup FM, Scheutz F. Быстрое и простое серотипирование in silico изолятов Escherichia coli с использованием данных полногеномного секвенирования. Дж. Клин Микробиол. 2015;53: 2410–26. 10.1128/JCM.00008-15 [бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
37. Sheikh J, Czeczulin JR, Harrington S, Hicks S, Henderson IR, Le Bouguénec C, et al. Новый белок дисперсин в энтероагрегативной кишечной палочке. Джей Клин Инвест. 2002; 110: 1329–1337. 10.1172/JCI16172 [бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
38. Cerna JF, Nataro JP, Estrada-Garcia T.
Мультиплексная ПЦР для обнаружения трех плазмидных генов энтероагрегативных штаммов Escherichia coli. Дж. Клин Микробиол. 2003; 41: 2138–40. Доступно: http://www.pubmedcentral.nih.gov/articlerender.fcgi?artid=154749&tool=pmcentrez&rendertype=abstract [бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar]
39. Nataro JP, Deng Y, Maneval DR, Герман А.Л., Мартин В.К., Левин М.М. Агрегатные фимбрии адгезии I энтероагрегантной кишечной палочки опосредуют адгезию к клеткам HEp-2 и гемагглютинацию эритроцитов человека. Заразить иммун. 1992;60: 2297–304. Доступно: http://www.pubmedcentral.nih.gov/articlerender.fcgi?artid=257157&tool=pmcentrez&rendertype=abstract [бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar]
40. Pichel M, Binsztein N, Viboud G. CS22, новый человеческий энтеротоксигенный адгезин Escherichia coli, родственен CS15. Заразить иммун. 2000;68: 3280–5. Доступно: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/10816474 [бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar]
41. Огунный А.
Д., Котлярский И., Морона Р., Мэннинг П.А. Роль белка субъединицы SefA фимбрии SEF14 в патогенезе Salmonella enterica serovar Enteritidis. Заразить иммун. 1997. Доступно: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC176117/pdf/650708.pdf [бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar]
42. Collighan RJ, Woodward MJ . Фимбриальный антиген SEF14 серовара Enteritidis Salmonella enterica кодируется внутри островка патогенности. Вет микробиол. 2001; 80: 235–245. 10.1016/S0378-1135(01)00309-1 [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
43. EnteroBase. Доступно: http://enterobase.warwick.ac.uk/species/index/ecoli
44. Izquierdo M, Navarro-Garcia F, Nava-Acosta R, Nataro JP, Ruiz-Perez F, Farfan MJ. Идентификация белков, находящихся на клеточной поверхности, участвующих в опосредованной фимбриями адгезии энтероагрегативной кишечной палочки к клеткам кишечника. Заразить иммун. 2014;82:1719–24. 10.1128/IAI.01651-13 [бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
45.
Rajan A, Vela L, Zeng XL, Yu X, Shroyer N, Blutt SE, et al.
Новые специфические для сегмента и хозяина паттерны энтероагрегативной кишечной палочки прилипания к кишечным энтероидам человека.
МБио. 2018;9
10.1128/mBio.02419-17 [бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
46. Gonyar LA, Smith RM, Giron JA, Zachos NC, Ruiz-Perez F, Nataro JP. Агрегатное прилипание фимбрии II энтероагрегативного Escherichia coli необходимы для прилипания и разрушения барьера во время инфицирования колоноидов человека. Заразить иммун. 2020. [по состоянию на 13 июля 2020 г.]. 10.1128/IAI.00176-20 [бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
47. Mandomando I, Vubil D, Boisen N, Quintó L, Ruiz J, Sigaúque B, et al. Клоны Escherichia coli st131, содержащие фимбрии AGGR и AAF/V, вызывающие бактериемию у мозамбикских детей: появление нового варианта субклона FIMh37. PLoS Negl Trop Dis. 2020; 14: 1–21. 10.1371/journal.pntd.0008274 [бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
48.
Zhou Z, Ogasawara J, Nishikawa Y, Seto Y, Helander A, Hase A, et al.
Вспышка гастроэнтерита в Осаке, Япония, вызванная Escherichia coli серогруппы O166:h25, у которой был кодирующий ген энтероагрегативного термостабильного энтеротоксина 1 E. coli (EAST1).
Эпидемиол инфекции. 2002;128: 363 Доступно: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC2869831/ [бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar]
49. Brolund A. Обзор Enterobacteriaceae , продуцирующих БЛРС, с точки зрения северных стран. Заразить Экол Эпидемиол. 2014;4: 24555 10.3402/iee.v4.24555 [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
50. Клермон О., Кристенсон Дж.К., Денамур Э., Гордон Д.М. Новый взгляд на метод филотипирования Clermont Escherichia coli: улучшение специфичности и выявление новых филогрупп. Environ Microbiol Rep. 2013; 5: 58–65. 10.1111/1758-2229.12019 [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
51. Skjøt-Rasmussen L, Ejrnæs K, Lundgren B, Hammerum AM, Frimodt-Møller N.
бактериемия мочевыводящих путей связана с полом и госпитальным или внебольничным происхождением. Int J Med Microbiol. 2012;302:129–134. 10.1016/J.IJMM.2012.03.002 [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
52. Pfaff-McDonough SJ, Horne SM, Giddings CW, Ebert JO, Doetkott C, Smith MH, et al. Дополнительные черты, связанные с резистентностью, среди изолятов Escherichia coli от внешне здоровых птиц и птиц с колибактериозом. Авиан Дис. 44: 23–33. Доступно: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/10737641 [PubMed] [Google Scholar]
53. Rodriguez-Siek KE, Giddings CW, Doetkott C, Johnson TJ, Fakhr MK, Nolan LK. Сравнение изолятов Escherichia coli, вызывающих инфекцию мочевыводящих путей человека и птичий колибактериоз. Микробиология. 2005;151:2097–2110. 10.1099/mic.0.27499–0 [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
54. Джонсон Т.Дж., Ваннемюлер Ю.М., Нолан Л.К. Эволюция гена iss у Escherichia coli. Appl Environ Microbiol. 2008; 74: 2360–2369. 10.1128/AEM.02634-07 [бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
55.
Stumpe S, Schmid R, Stephens DL, Georgiou G, Bakker EP. Идентификация OmpT как протеазы, которая гидролизует противомикробный пептид протамин до того, как он попадет в растущие клетки Escherichia coli. J Бактериол. 1998; 180: 4002–6. Доступно: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/9683502 [бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar]
56. Binns MM, Davies DL, Hardy KG. Клонированные фрагменты плазмиды ColV,I-K94, определяющие вирулентность и резистентность к сыворотке. Природа. 1979; 279: 778–781. 10.1038/279778a0 [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
57. He XL, Wang Q, Peng L, Qu Y-R, Puthiyakunnon S, Liu X-L, et al. Роль уропатогенного белка Т внешней мембраны Escherichia coli в патогенезе инфекции мочевыводящих путей. Патог Дис. 2015;73 10.1093/femspd/ftv006 [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
58. Johnson JR, Kaster N, Kuskowski MA, Ling G V. Определение признаков уровирулентности у Escherichia coli путем сравнения мочевых и ректальных изолятов E. coli из собаки с инфекцией мочевыводящих путей.
Дж. Клин Микробиол. 2003; 41: 337–45. 10.1128/jcm.41.1.337–345.2003 [бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
59. Okeke IN, Wallace-Gadsden F, Simons HR, Matthews N, Labar AS, Hwang J, et al. . Многолокусное сиквенс-типирование энтероагрегативных изолятов кишечной палочки нигерийских детей выявляет множественные клоны. ПЛОС Один. 2010;5 10.1371/journal.pone.0014093 [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
60. Boll EJ, Struve C, Boisen N, Olesen B, Stahlhut SG, Krogfelt KA. Роль энтероагрегативных факторов вирулентности Escherichia coli в уропатогенезе. Заразить иммун. 2013; 81: 1164–1171. 10.1128/IAI.01376-12 [бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
61. Olesen B, Scheutz F, Andersen RL, Menard M, Boisen N, Johnston B, et al. Энтероагрегатная кишечная палочка O78:h20, причина вспышки инфекции мочевыводящих путей. Дж. Клин Микробиол. 2012; 50: 3703–3711. 10.1128/JCM.01909-12 [бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
62.
Nunes KO, Santos ACP, Bando SY, Silva RM, Gomes TAT, Elias WP. Энтероагрегатная кишечная палочка с уропатогенными характеристиками присутствует в фекалиях больных диареей и здоровых детей.
Патог Дис.
2017;75
10.1093/femspd/ftx106 [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
63. Элиас В.П., Чечулин Дж.Р., Хендерсон И.Р., Трабулси Л.Р., Натаро Дж.П. Организация генов биогенеза для фимбрий агрегации адгезии II определяет кластер генов вирулентности в энтероагрегативной Escherichia coli. J Бактериол. 1999; 181: 1779–85. Доступно: http://www.pubmedcentral.nih.gov/articlerender.fcgi?artid=93575&tool=pmcentrez&rendertype=abstract [бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar]
Энтероагрегативные штаммы Escherichia coli среди классических энтеропатогенных Escherichia coli O серогрупп
J Clin Microbiol. 2002 сен; 40(9): 3540–3541.
doi: 10.1128/JCM.40.9.3540-3541.2002
Информация об авторе Информация об авторских правах и лицензии Отказ от ответственности
Энтероагрегат Escherichia coli (EAEC) является новой причиной диареи как в развивающихся, так и в развитых странах (6), которая определяется характерным паттерном агрегации (АА) с культивируемыми эпителиальными клетками (7).
Исследования, проведенные в различных лабораториях, показали, что некоторые энтеропатогенные серогруппы E. coli (EPEC) состоят из серотипов, в основном состоящих из штаммов EAEC (2, 5, 9, 10). Эти серотипы обладают интересными характеристиками: т. е. они были выделены из случаев острой детской диареи до того, как АА была признана отдельным типом приверженности, и в большинстве случаев экспрессируют АА только в 6-часовом анализе приверженности (5, 9)., 10).
Мы исследовали нашу лабораторную коллекцию штаммов E. coli , которые представляют фенотип AA для клеток HEp-2 и принадлежат к серогруппам EPEC O (L. R. Trabulsi, неопубликованные данные) на наличие маркеров вирулентности, связанных с EAEC (3) . Были отобраны 34 штамма-продуцента АК следующих серотипов: O86:h3, O111:h5, O111:h20, O111:h22, O111:h31, O125:H6, O125:h26, O125:h31, O126:h37, О128:h22 и О128:h45. Сначала штаммы анализировали на наличие интимина ( eae ) и гены структурной субъединицы ворсинок ( bfpA ) EPEC (6). 44444444444444444444444) EAC-EAC-EAC-EAC-EAC-EAC-EAC-EAC-EAC-EAC-EAC- и PIC9444444444444444444444444444444). Последовательность зонда EAEC (8) также исследовали с помощью ПЦР, как описано ранее (3, 4, 8). Все оцениваемые штаммы дали отрицательный результат на присутствие генов вирулентности EPEC, за исключением двух штаммов O125:H6, которые содержали ген eae .
ПЦР для eae проводили, как описано ранее (1). Праймеры, использованные для обнаружения bfpA (прямой, 5′-GGTCTGTCTTTGATTGAATC-3′; и обратный, 5′-TTTACATGCAGTTGCCGCTT-3′), были основаны на его опубликованной последовательности (инвентарный номер GenBank {«type»:»entrez-нуклеотид «,»attrs»:{«text»:»NC_002142″,»term_id»:»10955350″,»term_text»:»NC_002142″}}NC_002142) для амплификации фрагмента размером 485 п.н. Наличие плазмиды ( AGGA , AAFA , Aggr , ASTA , PET , ASPU и SHF ) и хромосомный ( IRP2 и Pic
Интересно, что у этих последних штаммов отсутствовали все оцененные маркеры EAEC (таблица) и они демонстрировали паттерн AA для клеток HEp-2 в анализе 6-часовой адгезии. Все остальные исследованные серотипы представляли по крайней мере один маркер EAEC (таблица). Наиболее распространенными маркерами были irp2 , astA , shf и pic , которые также были описаны как распространенные среди штаммов EAEC (3). Ген агрегатного прилипания фимбриального пилина I ( agGA ) (6) был единственным маркером EAEC, который не был обнаружен. Это согласуется с низкой распространенностью agA , обнаруженной в другом исследовании (4). Таблица 10003 Серотип Количество штаммов (%) Количество положительных штаммов (%) eae bfpA EAEC a aggA aafA aggR aspU shf pet АСТА рис. 
irp-2 O86:h3 4 4 4 3 3 3 3 O111: h5 1 1 O111:h20 2 1 1 1 1 2 2 2 O111:h22 8 4 8 7 7 O111:h31 4 4 4 4 1 4 3 3 O125:H6 2 2 O125:h26 1 1 1 1 1 O125:h31 1 1 1 1 1 1 1 1 O126:h37 2 2 1 1 1 1 1 1 1 2 O128:h22 1 1 O128:h45 8 7 7 5 Total 34 (100) 2 (5. 
9) 0 14 (41,2) 0 2 (5,9) 12 (35,3) 11 (32,3) 19 (55,9) 11 (32,3) 19 (55,9). 17 (50) 24 (70,6)
Открыть в отдельном окне
a Последовательность датчиков EAEC.
EAEC очень неоднородны в отношении наличия предполагаемых маркеров вирулентности, и хотя некоторые из этих маркеров часто встречаются в этой категории, чувствительный генный зонд для идентификации EAEC еще не доступен (6).
Соответственно, адгезия к эпителиальным клеткам остается «золотым стандартом» диагностического теста для категории (7). Наши результаты показали, что, за исключением O125:H6, который был классифицирован как атипичный EPEC (10), изученные здесь серотипы следует рассматривать как EAEC, поскольку они представляют собой AA-паттерн и большую часть вирулентности, связанной с EAEC. гены. В наших лабораториях продолжаются исследования, чтобы охарактеризовать адгезин, опосредующий фенотип AA серотипа O125:H6, и выяснить, способны ли эти штаммы вызывать характерное повреждение прилипания и стирания EPEC (6). Наши результаты имеют клиническое и эпидемиологическое значение, поскольку идентификация ЕРЕС по серогруппе О вводит в заблуждение, поскольку серогруппы ЕРЕС включают разные патогены. Следовательно, серогруппирование O должно быть дополнено типированием жгутиков (H) или, альтернативно, тестированием адгезии к эпителиальным клеткам.
1. Бэтчелор, М., С. Кнуттон, А. Каприоли, В.
Хутер, М. Заниал, Г. Дуган и Г. Франкель. 1999. Разработка универсальной антисыворотки к интимину и праймеров для ПЦР. Дж. Клин. микробиол. 37 : 3822-3827. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar]
2. Кампос, Л. К., Т. С. Уиттам, Т. А. Т. Гомес, Дж. Р. К. Андраде и Л. Р. Трабулси. 1994. Escherichia coli серогруппы О111 включает несколько клонов диареегенных штаммов с различными свойствами вирулентности. Заразить. Иммун. 62 : 3282-3288. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar]
3. Чечулин, Дж. Р., Т. С. Уиттам, И. Р. Хендерсон, Ф. Наварро-Гарсия и Дж. П. Натаро. 1999. Филогенетический анализ энтероагрегантной и диффузно-адгезивной Escherichia coli . Заразить. Иммун. 67 : 2692-2699. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar]
4. Джоппо, Н. М. Р., В. П. Элиас-младший, М. К. Видотто, Р. Э. Линьярес, Х. О. Саридакис, Т.
А. Т. Гомес, Л. Р. Трабулси и Дж. С. Пелайо. 2000. Преобладание прикрепленной к клеткам HEp-2 Escherichia coli и характеристика энтероагрегантной E. coli и цепочечной адгезивной E. coli , выделенных у детей с диареей и без нее, в Лондрине, Бразилия. ФЭМС микробиол. лат. 190 : 293-298. [PubMed] [Google Scholar]
5. Монтейро-Нето, В., Л. К. Кампос, А. Дж. П. Феррейра, Т. А. Т. Гомеш и Л. Р. Трабулси. 1997. Вирулентность Escherichia coli Штаммы O111:h22. ФЭМС микробиол. лат. 146 : 123-128. [PubMed] [Google Scholar]
6. Натаро, Дж. П. и Дж. Б. Капер. 1998. Диареогенный Escherichia coli . клин. микробиол. Ред. 11 : 142-201. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar]
7. Натаро, Дж. П., Дж. Б. Капер, Р. Робинс-Браун, В. Прадо, П. Виал и М. М. Левин. 1987. Закономерности прикрепления диареегенной Escherichia coli к клеткам НЕр-2.
Педиатр. Заразить. Дис. Дж. 6 : 829-831. [PubMed] [Google Scholar]
8. Шмидт Х., К. Кноп, С. Франке, С. Алексич, Дж. Хеземанн и Х. Карч. 1995. Разработка ПЦР для скрининга энтероагрегантов Escherichia coli . Дж. Клин. микробиол. 33 : 701-705. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar]
9. Шотландия, С. М., Х. Р. Смит, Т. Чести, Б. Саид, Г. А. Уиллшоу, Н. Стоукс и Б. Роу. 1996. Использование генных зондов и тестов на адгезию для характеристики Escherichia coli , принадлежащая к энтеропатогенным серогруппам, выделенным в Соединенном Королевстве. Дж. Мед. микробиол. 44 : 438-443. [PubMed] [Google Scholar]
10. Валле, Г. Р. Ф., Т. А. Т. Гомес, К. Ирино и Л. Р. Трабулси. 1997. Традиционная энтеропатогенная Escherichia coli (EPEC) серогруппы O125 включает серотипы, которые в основном связаны с категорией энтероагрегантных E.