Территориальный отдел Управления Федеральной службы по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека по Республике Дагестан в городе Каспийске | ||
368300, Республика Дагестан, город Каспийск, улица Советская, дом 2, [email protected] | ||
(осуществляет надзор на территории города Каспийск, Карабудахкентского района) | ||
Должность | Ф.И.О. | Рабочий телефон |
начальник | Абачараев Омар Алиханналаевич | 8 (246) 6-70-70 6-37-77 |
зам.начальника | Анохина Елена Александровна | 8(246) 6-71-86 6-15-16 |
Территориальный отдел Управления Федеральной службы по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека по Республике Дагестан в городе Избербаше | ||
368500, Республика Дагестан, город Избербаш, улица Громова, дом 3, to-izberg@yandex. | ||
(осуществляет надзор на территории города Избербаш, Каякентского, Сергокалинского районов) | ||
Должность | Ф.И.О. | Рабочий телефон |
начальник | Лукманов Мурад Зияудинович | 8 (245)2-38-35 2-17-28 |
зам.начальника | Гаджиев Гамид Гаджиевич | 8 (245) 2-59-23 |
Территориальный отдел Управления Федеральной службы по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека по Республике Дагестан в городе Дербенте | ||
368600, Республика Дагестан, город Дербент, улица Шеболдаева, дом 49, [email protected] | ||
(осуществляет надзор на территории города Дербент, Дербентского района, города Дагестанские Огни, Сулейман — Стальского, Курахского, Хивского, Агульского районов) | ||
Должность | Ф. | Рабочий телефон |
И.о.начальника | Аджиев Рашид Шапиюлаевич | 8(240)2-81-96 4-18-66 |
зам.начальника | Гамзаев Бейдуллах Исмаилович | 8(240) 2-81-96 4-36-803 |
Территориальный отдел Управления Федеральной службы по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека по Республике Дагестан в городе Буйнакске | ||
368220, Республика Дагестан, город Буйнакск, ул. И- Газимагомеда, дом 2, [email protected] | ||
(осуществляет надзор на территории города Буйнакск, Буйнакского, Унцукульского районов) | ||
Должность | Ф.И.О. | Рабочий телефон |
начальник | Авкаева Заира Гусейновна | 8 (237)2-03-48 2-27-23 |
зам. | Исаев Абдула Нурмагомедович | 8(237)2-35-70 |
Территориальный отдел Управления Федеральной службы по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека по Республике Дагестан в городе Кизилюрте | ||
368120, Республика Дагестан, город Кизилюрт, улица Алиева, дом 29, [email protected] | ||
(осуществляет надзор на территории города Кизилюрт, Кизилюртовского, Казбековского, Кумторкалинского районов) | ||
Должность | Ф.И.О. | Рабочий телефон |
начальник | Шамхалов Магомед Муртазалиевич | 8(234) 2-12-48 4-13-52 |
зам.начальника | Адигузелов Низами Аждарович | 8 (234)2-12-48 3-19-19 |
зам. | Омаров Омар Ахмедович | 8 (279) 2-17-14 2-22-41 |
Территориальный отдел Управления Федеральной службы по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека по Республике Дагестан в городе Хасавюрте | ||
368000, Республика Дагестан, город Хасавюрт, Махачкалинское шоссе, дом 12а, [email protected] | ||
(осуществляет надзор на территории города Хасавюрт, Новолакского, Хасавюртовского районов) | ||
Должность | Ф.И.О. | Рабочий телефон |
начальник | Омарова Аида Анварбековна | 8 (231)0-30-54 |
зам.начальника | Дарцаева Рукият Султановна | 8 (231) 0-30-54 |
Территориальный отдел Управления Федеральной службы по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека по Республике Дагестан в городе Кизляре | ||
368832, Республика Дагестан, город Кизляр, Махачкалинское, дом 10, to-kizlyar@yandex. | ||
(осуществляет надзор на территории города Кизляр, Кизлярского, Бабаюртовского, Тарумовского, Ногайского районов, города Южно-Сухокумск) | ||
Должность | Ф.И.О. | Рабочий телефон |
начальник | Каяев Тайзуллах Рамазанович | 8 (239) 2-31-09 |
зам.начальника | Копытова Лия Викторовна | 8 (261) 3-14-45 3-13-57 |
зам.начальника | Степаненко Юлия Викторовна | 8 (239) 2-31-09 |
Территориальный отдел Управления Федеральной службы по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека по Республике Дагестан в Ботлихском районе | ||
368970, Республика Дагестан, Ботлихский район, село Ботлих, ул. Центральная 15, to-botlih@yandex. | ||
(осуществляет надзор на территории Ботлихского, Цумадинского, Ахвахского, Гумбетовского районов) | ||
Должность | Ф.И.О. | Рабочий телефон |
начальник | Таймасханов Магомед Рашидханович | 8 (271)2-20-93 |
Территориальный отдел Управления Федеральной службы по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека по Республике Дагестан в Хунзахском районе | ||
368260, Республика Дагестан, Хунзахский район, село Арани, [email protected] | ||
(осуществляет надзор на территории Хунзахского, Шамильского, Тляратинского, Цунтинского районов) | ||
Должность | Ф.И.О. | Рабочий телефон |
начальник | Магомеднабиев Магомед Шагабудинович | 8(233)2-23-06 |
Территориальный отдел Управления Федеральной службы по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека по Республике Дагестан в Гунибском районе | ||
368340, Республика Дагестан, Гунибский район, село Гуниб, ул. | ||
(осуществляет надзор на территории Гунибского, Чародинского, Гергебильского районов) | ||
Должность | Ф.И.О. | Рабочий телефон |
и.о. начальник | Гаджиева Заират Магомедовна | 8(258)21-8-35 |
Территориальный отдел Управления Федеральной службы по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека по Республике Дагестан в Левашинском районе | ||
368320, Республика Дагестан, Левашинский район, село Леваши, ул. Даудова -1, [email protected] | ||
(осуществляет надзор на территории Левашинского, Акушинского районы) | ||
Должность | Ф.И.О. | Рабочий телефон |
начальник | Амиров Султанбек Айгумович | 8(252) 2-11-96 |
Территориальный отдел Управления Федеральной службы по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека по Республике Дагестан в Кулинском районе | ||
368390, Республика Дагестан, Кулинский район, село Вачи, ул. | ||
(осуществляет надзор на территории Кулинского, Лакского районов) | ||
Должность | Ф.И.О. | Рабочий телефон |
начальник |
| 8 (268)2-11-00 8(267) 3-42-08 |
Территориальный отдел Управления Федеральной службы по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека по Республике Дагестан в Кайтагском районе | ||
368590, Республика Дагестан, Кайтагский район, село Маджалис, [email protected] | ||
(осуществляет надзор на территории Кайтагского, Дахадаевского, Табасаранского районов) | ||
Должность | Ф.И.О. | Рабочий телефон |
начальник | Мятов Нурмагомед Гаджимурадович | 8 (238)4-75-70 4-52-39 |
зам. | Бамматова Шахсенем Абдулатиповна | 8 (249)23-0-38 |
Территориальный отдел Управления Федеральной службы по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека по Республике Дагестан в Магарамкенском районе | ||
368780, Республика Дагестан, Магарамкентский район, село Магарамкент, улица Лезгинцева, дом 4, [email protected] | ||
(осуществляет надзор на территории Магарамкентский район) | ||
Должность | Ф.И.О. | Рабочий телефон |
начальник | Алиев Икрам Ямуддинович | 8 (235) 21-4-47 |
Территориальный отдел Управления Федеральной службы по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека по Республике Дагестан в Ахтынском районе | ||
368730, Республика Дагестан, Ахтынский район, село Ахты, улица Ленина, дом 51, to-ahty@yandex. | ||
(осуществляет надзор на территории Ахтынского, Рутульского, Докузпаринского районов) | ||
Должность | Ф.И.О. | Рабочий телефон |
начальник | Касимов Арсен Сейфулахович | |
ru
И.О.
начальника
начальника
ru
ru
И-Шамиля 16, 
Спортивный переулок 149 а, 
начальника
ruПортал, позволяющий подать заявку предпринимателям для ведения деятельности, запущен в Дагестане
В Республике Дагестан запущен портал, регламентирующий деятельность предприятий и торговых точек в период режима повышенной готовности. Предприниматели на портале смогут подать заявку в региональный Роспотребнадзор, а пользователи сети могут получить доступ к реестру предприятий, имеющих разрешение на ведение своей деятельности.На сайте Мой Дагестан https://mydagestan.e-dag.ru/ размещена форма заявки, которую необходимо заполнить для получения уведомления. После отправки формы, заявителю придет электронное письмо с QR-кодом.
Предприниматели смогут разместить QR-код в виде картинки на входе в торговую точку или офис. Отсканировав этот код, граждане смогут убедиться в санитарной безопасности данной торговой точки. В то же время, доступ к базе данных заявок имеют МВД по РД и контролирующие органы, которые могут оперативно, не создавая лишних помех предпринимателям, проверить объект на право его функционирования в период режима повышенной готовности.
Для снижения коррупционных рисков, Оперативным штабом по недопущению распространения новой коронавирусной инфекции совместно с руководством Роспотребнадзора РД на сайте размещен телефон горячей линии и адрес электронной почты для обратной связи с предпринимательским сообществом и граждан. Обращаем ваше внимание на то, что предпринимателям, ранее подавшим заявки, нет необходимости в ее повторном заполнении. В настоящий момент идет синхронизация баз данных. Вся актуальная информация будет размещена на данном портале. Начиная с 16:00 14-го апреля все заявки будут подавать только через портал «Мой Дагестан».
Операторами системы выступают:
— Управление Роспотребнадзора по РД отвечает за вопросы проведения выездного инструктажа и оценки в рамках Методических рекомендаций для работодателей по профилактике коронавирусной инфекции на рабочих местах. Контакты: телефон: 8 (8722) 69-03-05, электронная почта Этот адрес электронной почты защищён от спам-ботов. У вас должен быть включен JavaScript для просмотра.
— Агентство по предпринимательству и инвестициям Республики Дагестан отвечает за взаимодействие между предпринимателями Республики Дагестан, Роспотребнадзором РФ по РД и Минкомсвязи РД. Контакты: телефон: 8 (8722) 67-13-75, электронная почта Этот адрес электронной почты защищён от спам-ботов. У вас должен быть включен JavaScript для просмотра.
— Минкомсвязь РД является технологическим оператором портала. Контакты: телефон: 8 (8722) 51-03-60, электронная почта Этот адрес электронной почты защищён от спам-ботов. У вас должен быть включен JavaScript для просмотра.
Напомним, что 08 апреля 2020 года Главой Республики Дагестан В.
А. Васильевым подписано Распоряжение № 27 «Об утверждении перечня организаций, на которые не распространяется действие Указа Президента Российской Федерации от 02 апреля 2020 года № 239». Данное Распоряжение предписывает руководителям организаций обратиться в Управление Роспотребнадзора по РД для включения в реестр организаций, в соответствии с пунктом 2 распоряжения Главы Республики Дагестан от 8 апреля 2020 года № 27-рг.
Официальный сайт города Махачкалы
Настоящие рекомендации предназначены для временного руководства органов местного самоуправления, государственных органов, учреждений здравоохранения, ритуальных организаций и семей, которые имеют отношение к погребению умерших от новой коронавирусной инфекции.
Рекомендации разработаны в соответствии с Рекомендациями Всемирной организации здравоохранения «Профилактика и контроль инфекций для безопасного обращения с трупами в контексте COVID-19», ФЗ №131 «Об общих принципах организации местного самоуправления в Российской Федерации» от 6 октября 2003г.
Порядок подготовки, перевозки и погребения
1. Подготовку и упаковку тела умершего для погребения произвести в условиях морга специалистами патологоанатомической службы.
2. Обеспечить соблюдение лицами, которые взаимодействуют с телом умершего, стандартных мер предосторожности, включая гигиену рук до и после взаимодействия с телом умершего и окружающей средой, использование соответствующих средств индивидуальной защиты (халат и перчатки, лицевой щит или защитные очки, медицинская маска).
3. Обеспечить меры по исключению вытекания любых жидкостей из отверстий тела умершего.
4. Обернуть тело умершего специально обработанной тканью 5% дезинфицирующего раствора хлорамина или хлорной извести, далее обернуть полиэтиленовой пленкой и повторно завернуть в плотную ткань.
5. Свести к минимуму передвижение тела умершего и манипуляции с ним.
6. Перевезти тело умершего к месту погребения в сопровождении близких родственников умершего (не более 5 человек) с соблюдением санитарно-эпидемиологических требований.
7. Члены семьи умершего, присутствующие при подготовке тела к погребению, должны соблюдать стандартные меры предосторожности, включая гигиену рук, лица. Исключить любые касания тела умершего.
8. Исключить участие родственников в возрасте 65 лет и старше, имеющие хронические заболевания, несовершеннолетних детей и лиц с иммунодефицитом в процедуре подготовки тела умершего к погребению.
9. Исключить вскрытие гроба, савана, осмотр тела умершего близкими родственниками и иными лицами на месте погребения.
10. При погребении допускается прощание с телом умершего не более чем 30 минут на расстоянии не менее 3 метров в присутствии близких родственников под контролем органов местного самоуправления.
11. После перевозки и захоронения умерших транспорт должен в обязательном порядке подвергаться уборке и дезинфекции дезсредствами, разрешенными к применению в установленном порядке.
Роспотребнадзор просит ужесточить ограничения из-за новых очагов коронавируса в Дагестане — Общество
МАХАЧКАЛА, 4 апреля. /ТАСС/. Управление Роспотребнадзора по Дагестану предлагает ужесточить ограничительные меры из-за появления новых очагов коронавирусной инфекции. Об этом сообщается в субботу на официальном сайте главы и правительства Дагестана со ссылкой.
«На территории республики за прошедшие сутки сформировался один новый очаг в одном из районов города Махачкалы, и имеется очаг с 79 контактными лицами в Ботлихском районе. <…> Если ранее мы могли четко определить круг лиц, которые стали источником формирования очагов, установить и взять под изоляцию всех контактных и тем самым изолировать потенциальных распространителей инфекции, то в последних очагах отсутствует понимание источников инфекции.
По его мнению, на данном этапе вирус циркулирует в окружающей среде. «Он есть в воздухе, на почве, на предметах, в транспорте, общественных местах, и риск заражения граждан кратно увеличивается. Уже не обязательно контактировать с больными или носителями, достаточно просто проехаться в общественном транспорте, посидеть на лавочке где-нибудь на территории города, посетить общественные места, которыми в настоящее время являются магазины, аптеки и иные учреждения, которые граждане имеют право посещать», — считает руководитель управления
Для предотвращения распространения инфекции предлагается, в частности, ограничить работу мечетей.
«У нас до настоящего времени существуют случаи посещения гражданами республики общественных мест, в том числе мечетей. Предлагаю ограничить работу данных духовных учреждений в связи с ухудшением общей эпидемиологической обстановки», — отметил Павлов, добавив, что в республике разработан план действий по организации противоэпидемических мероприятий для предотвращения распространения коронавируса на территории Дагестана. В настоящее время документ проходит согласование «во всех заинтересованных ведомствах и структурах».
Ранее в субботу в пресс-службе Минздрава Дагестана сообщили, что с подозрением на коронавирус госпитализирован врач Ботлихской районной больницы. Его состояние оценивается как удовлетворительное.
По данным Роспотребнадзора, в республике подтверждено 25 случаев заражения коронавирусом. «Сегодня предстоит большой объем работы по постановке на карантин лиц, вернувшихся из-за рубежа и находящихся на территории Дагестана. В этом отношении проведена совместная работа с МВД по Республике Дагестан, определено нахождение данных лиц, подготовлены соответствующие постановления, которые начнут вручаться в обязательном порядке», — также говорится в сообщении.
Россия пытается импортировать лекарства от COVID-19 в связи с высоким уровнем смертности
ФОТО ФАЙЛА: Медицинские работники перевозят пациента в городскую клиническую больницу номер 52, где проходят лечение пациенты, страдающие коронавирусной болезнью (COVID-19), в Москве, Россия 8 октября 2020 г. REUTERS / Максим Шеметов
МОСКВА (Рейтер) — Россия пытается импортировать иностранные лекарства для борьбы с пандемией COVID-19 из-за нехватки продуктов у себя дома, заявил во вторник министр здравоохранения Михаил Мурашко, а Власти сообщили о рекордных 569 новых случаях смерти от коронавируса ежедневно.
Россия разрабатывает несколько вакцин против вируса и производит некоторые лекарства внутри страны, в том числе Коронавир и Авифавир, оба на основе фавипиравира, который был разработан в Японии и широко используется там в качестве основы для лечения.
Во время встречи с высокопоставленными представителями правительства во вторник Мурашко сказал, что в некоторых регионах есть проблемы с поставками фавипиравира.
«Увеличились объемы поставок противосвертывающих средств. Но мы все еще видим, что дефицит в сети остается, и поэтому мы работаем с министерством торговли и промышленности над дополнительными поставками из-за границы », — сказал он.
Новые ежедневные числа инфицированных, которые составляли 26 402 во вторник, постепенно сокращаются с момента достижения рекордного уровня 27 ноября. Анна Попова, руководитель службы контроля здоровья потребителей Роспотребнадзора, заявила, что рост заболеваемости замедляется.
Однако премьер-министр Михаил Мишустин заявил, что ситуация остается довольно напряженной во многих из более чем 80 регионов России.
В 17 регионах количество больничных коек составляло менее 5%, сказал Мурашко, при этом наибольшую озабоченность вызывают балтийский эксклав Калининград и Санкт-Петербург.
Россия сопротивлялась введению ограничений во время второй волны вируса, предпочитая целевые ограничения.
Россия с 2322 056 инфекциями занимает четвертое место в мире по количеству случаев COVID-19 после США, Индии и Бразилии.
С начала пандемии зарегистрировано 40 646 смертей, связанных с COVID-19.
Репортаж Дарьи Корсунской и Владимира Солдаткина, доп репортаж Глеба Столярова; Написано Александром Марроу; Под редакцией Ника Макфи
Россия, тревога в стиле OMS, обнаруживающая заражение птиц AH5N8 en humanos
Пример модификации:
Роспотребнадзор, федеральное агентство, ответственное за защиту потребителя и человека, испускающее сигнал тревоги, обнаруживает наличие вируса AH5N8, отвечает за обнаружение вируса человека, зараженного вирусом.La noticia se presenta cuando, además de Rusia, China y otros países de Europa, Medio Oriente y África del Norte, зарегистрировать бротес-де-ла-энфермедад на проспекте.
De acuerdo con las autoridades rusas, el virus se detectó en siete personas que trabajan en una planta de aves de corral, ubicada al sur del país, donde una epidemia de gripe aviar afectó a los animales en diciembre de 2020.
«El Лаборатория имеет подтвержденный пример заражения вирусом группы A, птичьим гриппом AH5N8 (…) el descubrimiento fue detectado hace varios días, pero no queríamos dar la información hasta no estar absolutamente seguros de anna Попова, дирекция агентства Роспотребнадзора.
Представительство организации там же информирует, что лас персон, аффектадас се сиентен бьен «и нет настоящих сложностей (…), адемас се томарон лас медидас нечесариас пара контролирует положение дел», дижо.
Попова: «El descubrimiento da tiempo al mundo para prepararse»
Desde finales de 2020, la variante del AH5N8 de la gripe aviar ha generado problemsas de salud en animales de varios países sese Francia, Entre ellos hancia, donde finales de 2020 жертвовать миллионами животных для сдерживания пропаганды энфермедад.
Según la OMS, la transmisión de la influenza aviar a los seres humanos es poco frecuente y Requiere «contacto directo o cercano con aves infectadas o su entorno».
Sin embargo, este virus «debe vigilarse» porque tiene el Potencial de mutar.
«La Circación de ciertas variantes de la gripe aviar en aves de corral en todo el mundo es de preocupación de salud pública porque pueden causar enfermedades graves en humanos, que tienen poca o ninguna inmunidal al la virus», se.
Акуэрдо с авторизацией общественного спасения, возможно, что заражение вирусом заражения птиц вызвано вирусом гриппа птиц H5N1, H7N9 и H9N2.
Por ello, las autoridades rusasterminaron que la alertta temprana ofrece al mundo la posibilidad de prepararse a través de la creación de elementos de Detección y el desarrollo de una vacuna.
«El desarrollo de una vacuna es basic en caso de que el virus se vuelva más patógeno y más peligroso para los humanos, ganando la Capsuidad de Transmitirse de persona a persona (…) solo así estaríamos Complete armados y preparados», agregos .
El Laboratorio Vektor, perteneciente al Estado ruso, fue el que detectó la presencia del virus en los humanos.
Por ello, enfatizó sobre la necesidad de comenzar a desarrollar un sistema de pruebas «que allowa detectar, con rapidez, los casos de la enfermedad en humanos».
Qué se conoce de la gripe aviar
De acuerdo con el portal de la Clínica Mayo en Estados Unidos, la influenza aviar es causada por un tipo del virus de la influenza, que casi nunca infecta los humanos.Existen al menos unos 12 tipos de esta enfermedad y solamente dos cepas han infectado recientemente a los humanos, la AH5N1 y la AH7N9.
Para la OMS, передача вируса по человеческому роду «ocurre rara vez» и по общему признаку, который является персонами, которые должны исчезнуть с лица Земли.
Esta patología presenta condiciones similares a los de la influenza Традиционный. Los signos y síntomas de la influenza aviar pueden presentarse en un plazo de dos a siete días y los pacientes muestran tos, fiebre, dolor de garganta, dolor muscular, dolor de cabeza, falta de aire, entre otros.
De acuerdo con la agency de noticias de origen ruso, РИА Новости, Институт векторных данных Сибири информирует о комментируемом сообщении о человеческих ресурсах и вакууме против вируса AH5N8.
Con AFP и Reuters
Вторая российская вакцина, «эффективная на 100%», сообщает СМИ
МОСКВА (Рейтер) — Кандидатная вакцина против COVID-19, известная как EpiVacCorona, вторая в России зарегистрированная вакцина, доказала «100% эффективность» на ранних стадиях испытаний, российский потребитель Об этом местным СМИ сообщили в Роспотребнадзоре.
Данные, основанные на исследованиях фазы I и II, были опубликованы до начала более крупного исследования фазы III, в котором для сравнения обычно участвуют тысячи участников и группа плацебо.
«Эффективность вакцины складывается из ее иммунологической и профилактической эффективности», — сообщило ТАСС со ссылкой на Роспотребнадзор.
«По результатам первой и второй фаз клинических исследований иммунологическая эффективность вакцины EpiVacCorona составляет 100%.
«
Согласно государственному регистру испытаний, в исследованиях фазы I и II была проверена безопасность, побочные эффекты и иммуногенность потенциальной вакцины у 100 человек в возрасте от 18 до 60 лет.
Обычно тесты ранней стадии вакцины на людях основываются на показатели крови, показывающие иммунный ответ у участников, которые не подвергались воздействию вируса, в то время как результаты более крупных испытаний на поздних стадиях основаны на фактических инфекциях, перенесенных участниками в их обычной жизни.
Россия начала тестирование EpiVacCorona, которая находится в стадии разработки Институтом Сибири «Вектор» в ноябре.
Ранее в том же месяце Москва заявила, что ее другая утвержденная вакцина, Sputnik V, на 92% эффективна в защите людей от COVID-19, исходя из промежуточных результатов.
Россия заявила, что в этом году может вакцинировать 60% своего населения от COVID-19, и, хотя вакцина Sputnik V была легко доступна в Москве, распространение вакцины по всей стране идет медленно.
Президент России Владимир Путин приказал начать массовую вакцинацию на этой неделе.
EpiVacCorona будет использоваться в массовых вакцинациях с марта. Об этом агентству Интерфакс сообщила вице-премьер Татьяна Голикова.
В России зарегистрировано 3 612 800 случаев коронавируса, что является четвертым по величине показателем в мире. Число погибших от вируса составляет 66 623 человека.
(Отчет Марии Киселевой и Полины Ивановой; текст Александра Мэрроу; редактирование Кейт Келланд, Джейсон Нили и Дэвид Эванс)
Введение
Введение Этиологическим агентом сибирской язвы является грамположительная бактерия Bacillus anthracis. Ключевой особенностью этого микроорганизма, во многом определяющей его эпидемиологический потенциал и популяционную структуру, является способность образовывать эндоспоры, чрезвычайно устойчивые к неблагоприятным факторам окружающей среды и способные сохранять жизнеспособность в течение длительного времени [1–12].Высокая сохранность спор объясняет, что вспышки болезней, приводящие к значительному экономическому ущербу, массовой гибели скота и человеческим жертвам, могут происходить в регионах, где это заболевание не наблюдалось десятилетиями.
Кроме того, благодаря высокой вирулентности B. anthracis, стабильности эндоспор в окружающей среде и простоте культивирования эта бактерия может быть превращена в потенциальное биологическое оружие или инструмент для биотерроризма [13, 14], о чем свидетельствует письма, зараженные сибирской язвой, в 2001 г. в США [15].
В настоящее время сибирская язва очень редко встречается в большинстве европейских стран [16], но остается серьезной проблемой в основном в странах Африки к югу от Сахары и в некоторых регионах Азии [17–20]. Сибирская язва является эндемическим заболеванием в России, где заболевание проявляется спорадическими случаями среди животных и редкими случаями заболевания среди населения [21]. Наличие больших территорий, на которых обитают популяции диких и домашних копытных, создает благоприятный контекст для вспышек заболеваний, или эпизоотий, а низкая плотность населения на большей части территории страны затрудняет проведение противоэпидемических мероприятий и правильный учет сибирской язвы.
места захоронения животных.Предыдущие захоронения животных часто не документируются, а иногда и трупы не хоронили. Эти могильники и целые территории, где имели место предыдущие эпизоотии, могут оказаться вовлеченными в активную экономическую деятельность, что, учитывая потенциально высокую сохранность спор B. anthracis в холодных условиях, может привести к новым вспышкам болезни [22]. Особый интерес в этом отношении представляет тундровая зона России, расположенная между 55 и 68 градусами северной широты.
Одной из особенностей этой климатической зоны является наличие вечной мерзлоты.Вечная мерзлота определяется как материал литосферы (почва и отложения), постоянно подвергающийся воздействию температур ≤0 ° C и остающийся замороженным не менее двух лет подряд. Вечная мерзлота может достигать глубины более 1000 м и оставаться мерзлой в течение тысяч лет [23, 24]. В условиях вечной мерзлоты сохранность микроорганизмов может значительно увеличиваться, и поэтому мерзлота является своеобразным аккумулятором микробиоты [25, 26].
Сохранность спор бацилл, в том числе B. anthracis, в вечной мерзлоте теоретически должна значительно превосходить сохранность микроорганизмов в вегетативной форме.Следовательно, вечная мерзлота может позволить обнаружить архаичные формы этого микроорганизма, которые могут дополнить наши знания об эволюции микроба сибирской язвы. Мы исследовали штаммы B. anthracis, выделенные в двух тундровых зонах — во время вспышки сибирской язвы на Ямале летом 2016 г. и при извлечении палеонтологического материала из вечной мерзлоты в Якутии в 2015 г.
Летом 2016 г. на полуострове Ямал произошла вспышка сибирской язвы.Предыдущая вспышка сибирской язвы была зарегистрирована в 1941 году, а с 1968 года район был официально объявлен «свободной от сибирской язвы» территорией СССР. В 2007 году от обязательной вакцинации северных оленей отказались. 16 июля 2016 года Единая служба дежурного контроля Ямальского района получила сообщение о гибели оленей от частных оленеводов.
Гибель оленей началась в устье реки Неросавэяха у озера Писёто. Оленеводы сообщили, что больные животные стали вялыми, начали медленно двигаться, затем упали и быстро умерли.Никаких язв и повреждений кожи обнаружить не удалось. 17 и 18 июля в местность прибыла ветеринарная служба Ямало-Ненецкого автономного округа для диспансеризации животных и вскрытия. Патологический материал отправлен в Тюменскую областную ветеринарную лабораторию. Вскрытие показало сердечную и легочную недостаточность, а предварительный диагноз — смерть от теплового удара, поскольку в июле 2016 года была аномально жаркая погода с температурами выше 35 ° C. Дополнительные исследования, проведенные ветеринарами в стойбищах оленеводов 19–29 июля, позволили Тюменской областной ветеринарной лаборатории выявить подозрение на B.anthracis 24 июля и принять профилактические меры (вакцинация и химиотерапия, ограничение передвижения животных). Дополнительные образцы были отправлены во Всероссийский научно-исследовательский институт ветеринарной вирусологии и микробиологии (ВНИИВВМ) в г.
Покров (Московская область).
К настоящему времени болезнь наблюдалась в трех очагах: в районе озера Писёто, в Новопортовской тундре, в районе реки Еваяха. Очаги очагов были разделены расстояниями до 250 км, включая две водные преграды — Обскую губу (ширина от 30 до 80 км) и Тазовский лиман (средняя ширина 25 км).
25 июля ARSRIVVM получила полное лабораторное подтверждение наличия B. anthracis в пробах, взятых у мертвых оленей. Из одного образца выделена чистая культура B. anthracis, штамм получил название 5875. Губернатор Ямало-Ненецкого автономного округа ввел карантинный режим в Ямальском районе. Сотрудники Государственного научного центра прикладной микробиологии и биотехнологии (SRCAMB) и ARSRIVVM отправились в Салехард, чтобы взять образцы и проконсультироваться с местными санитарными и медицинскими учреждениями.26 июля прибыли специалисты Ставропольского противочумного института.
С 26 июля прибывшие специалисты организовали диагностическую лабораторию в Центре гигиены и эпидемиологии Ямало-Ненецкого автономного округа.
Во время вспышки этой диагностической лабораторией были исследованы образцы потенциально инфицированных людей. Медицинские власти приняли решение госпитализировать в Салехард всех детей из очагов заболевания даже без видимых признаков заболевания. Началась эвакуация людей в оборудованные к тому времени временные лагеря и проведена профилактическая антибактериальная терапия.Специалисты SRCAMB вылетели из Салехарда в очаг болезни в районе озера Письото для обследования местного населения и сбора образцов. До этого времени и местное население, и ветеринары, работающие в этой зоне вспышки, скептически относились к возможности заражения сибирской язвой и поддерживали гипотезу теплового шока, поскольку ряд других безвредных для человека инфекций мог вызвать смерть животных, ослабленных жарой. Кроме того, одновременно с началом вакцинации и антибактериальной терапии резко снизилась температура очага инфекции, поэтому были основания полагать, что прекращение новых случаев заболевания связано с понижением температуры.
Типичное развитие болезни было следующим: кажущийся здоровым олень внезапно становился слабым, не мог ходить, его заставляли лечь через несколько часов и умирали через несколько дополнительных часов. В большинстве случаев шла кровь из носа (иногда и из заднего прохода), трупное окоченение развивалось в обычное время.
Специалисты SRCAMB взяли пробы почвы, воды, крови, ушей и лимфатических узлов мертвых оленей. 27 июля образцы были доставлены в Салехард, а 28 июля — в SRCAMB.29 июля штамм 5875 был отправлен из ARSRIVVM в SRCAMB. В тот же день SRCAMB получил штамм, выделенный от больного человека (смытый от кожной инфекции), впоследствии названный Ямал_12, и насекомых, пойманных ветеринарами, работающими в зоне очага: девять Scopeuma stercorarium и четыре Hydrotaea dentipes из Салехарда. 13 августа SRCAMB получил штамм 6063, выделенный в зоне эпидемии ARSRIVVM.
Якутия пробы 12 августа 2015 года горняки добывают бивни мамонта из вечной мерзлоты на берегу реки Уяндина в Абыйском улусе Якутии в 57 км от райцентра Белая Гора («Белая гора», широта N68.
564567, долгота E144.769827) нашли двух замороженных котят пещерного льва Panthera leo spelaea. Открытие отличалось беспрецедентной степенью сохранности, шерсть и мягкие ткани животного были сохранены. Тела котят переданы палеонтологам. Некоторые пробы были отправлены в ближайшее научное учреждение — Институт нефти и газа СО РАН в Якутске (ИПМиР СО РАН) для микробиологического исследования. 1 июня 2016 г. в лаборатории геохимии каустобиолитов ИФМиР СО РАН был выделен неизвестный бациллоподобный штамм из пробы почвы (глубина отбора проб не известна) и отправлен в Институт генетики и селекции промышленных микроорганизмов (ГосНИИгенетика) в г. Москва для опознания.1 сентября 2016 г. этот штамм был идентифицирован как B. anthracis. Поскольку этот институт не имеет полномочий и оборудования для работы с патогенными микроорганизмами, эта исходная культура была уничтожена. 21 сентября 2016 года по приказу Главного государственного санитарного врача Якутии в месте палеонтологической находки были отобраны пробы почвы.
Шесть отдельно упакованных стеклянных банок с образцами грунта (по 200 г каждая), взятыми с глубины от одного до шести метров с интервалом в один метр, были получены SRCAMB в декабре 2016 года.
Все протоколы экспериментов на животных были одобрены Комитетом по биоэтике SRCAMB (разрешения №: VP-2016/4 и VP-2016/5). Они были выполнены в соответствии со страховкой благополучия животных NIH № A5476-01 от 02/07/2007, а также руководящими принципами и правилами Европейского Союза по обращению с лабораторными животными, уходу за ними и их защите (http://ec.europa.eu/ окружающая среда / химикаты / lab_animals / home_en.htm).
Животные были приобретены в Центре разведения лабораторных животных Института биоорганической химии им. Шемякина и Овчинникова, Пущино, Россия.Их размещали в клетках из поликарбоната с пространством для комфортного передвижения (пять мышей на клетку 484 см 2 или от двух до трех морских свинок на клетку 864 см 2 ) и легким доступом к пище и воде при постоянной температуре (22 ° C).
± 2 ° C) и влажности (50% ± 10%), а также 12-часовой световой цикл / 12-часовой темный цикл.
Утвержденные протоколы предоставили научно подтвержденные гуманные конечные точки, включая заранее установленные критерии эвтаназии умирающих животных путем вдыхания CO 2 .Животных усыпляли, когда они становились вялыми, обезвоженными, умирающими, неспособными вставать или не реагирующими на прикосновения. После периода наблюдения выжившие животные были умерщвлены.
МышиВо всех экспериментах использовали мышей BALB / C в возрасте от шести до восьми недель обоего пола и весом 18-20 г. Их кормили комбикормом для мышей ПК-120 (Лабораторкорм, Москва, Россия).
Для оценки вирулентности мышей случайным образом разделили на четыре группы по десять животных и инфицировали подкожно дозами 10 0 , 10 1 , 10 2 и 10 3 спор / животное.Их наблюдали в течение 30 дней после заражения.
Для биоанализа мы использовали группы из трех мышей для каждого исследуемого образца.
Мышам вводили подкожно во внутреннюю часть верхней части бедра образец, добавленный в 0,3 мл PBS. За животными наблюдали в течение десяти дней, после чего выживших мышей умерщвляли. Мертвых и умерщвленных мышей вскрывали, образцы селезенки и печени высевали на чашки Петри с селективным агаром с сибирской язвой (SRCAMB, Оболенск, Россия).
Морские свинки использовались для оценки вирулентности штаммов, выделенных во время ямальской эпидемии.Животных обоих полов в возрасте от пяти до семи недель массой 350–450 г кормили гранулированным кормом КК-122 (Лабораторкорм, Москва, Россия) в течение всего эксперимента (30 дней). Их случайным образом делили на три группы по пять животных и вводили подкожно во внутреннюю часть верхней части бедра дозами 10 2 , 10 3 , 10 4 спор / животное в 0,5 мл PBS. За ними наблюдали в течение 15 дней, после чего выживших животных умерщвляли. Образцы селезенки и печени мертвых и умерщвленных морских свинок инокулировали на чашки Петри с селективным агаром с сибирской язвой (SRCAMB, Оболенск, Россия).
Образцы насекомых отмывали от спирта стерильным PBS, измельчали в ступке со стерильным песком, и полученный гомогенат использовали для посева на твердые питательные среды и для выделения тотальной ДНК, которая использовалась для ПЦР.
Для культивирования бактерий использовали агар бактериальной культурыГРМ, селективный агар сибирской язвы [27], желточный агар и кровяной агар (SRCAMB, Оболенск, Россия).
Выделение ДНК и ПЦР-анализ.ДНК из полевых и клинических образцов выделяли с помощью «Набор реагентов« K-Sorb »для выделения ДНК на микроколонках» («Синтол», Москва, Россия).ДНК из бактериальных культур выделяли с помощью набора GenElute Bacterial Genomic DNA Kit (Sigma-Aldrich, Москва, Россия).
ПЦР-амплификаций проводили на системе CFX96 Real-Time PCR Detection System (Bio-Rad, Москва, Россия). Для анализа множественных локусов VNTR (переменное количество тандемных повторов) (MLVA) и генотипирования canSNP использовали 2,5 × PCRmix M-427 с SYBR-GreenI (Syntol, Москва, Россия).
Праймеры для ПЦР синтезированы ООО «Синтол», Россия.
ПЦР-детекцию ДНК B. anthracis проводили с использованием набора для ПЦР в реальном времени «MULTI-FLU» (SRCAMB, Оболенск, Россия) и «OM-screen-anthracis-RT» (Syntol, Москва, Россия).
MLVA выполняли с использованием праймеров, перечисленных в Thierry et al. [28]. Продукты моноплексной ПЦР и лестницу 20 п.н. (Bio-Rad, США) подвергали электрофорезу при 100 В в течение четырех часов на 3% -ном агарозном геле длиной 32 см, приготовленном в 0,5 × TBE. Фрагменты ДНК визуализировали окрашиванием бромидом этидия и ультрафиолетом (312 нм) с использованием системы гель-документирования Doc-Print и программного обеспечения PhotoCaptMw версии 99.04 (Vilber Lourmat, Marne-la-Vallée, France). Продукты ПЦР размером более 600 п.н. повторно анализировали в 2% агарозном геле для лучшего разрешения, и любую оставшуюся неоднозначность подтверждали с помощью автоматизированной системы электрофореза Experion (Bio-Rad, Москва, Россия) и секвенирования ДНК.
CanSNP-генотипирование проводили, как описано в [29].
штаммов Ямала проводили с использованием набора Ion Torrent PGM и связанных с ним реагентов Ion PGM Reagents 400 и Ion 318 Chip Kit (Life Technologies, Москва, Россия). Полногеномное секвенирование штаммов Якутии проводили на приборе Illumina MiSeq и Miseq Reagent Kit v3 (Альбиоген, Москва, Россия). Библиотеки ДНК готовили с использованием набора Nextera DNA Library Preparation Kit (Альбиоген, Москва, Россия).Архивы считываний последовательностей были депонированы под исследуемым доступом PRJEB30558 и могут быть восстановлены по адресу https://www.ebi.ac.uk/ena/data/view/PRJEB30558. Одиннадцать архивов пронумерованы от ERR3170358 до ERR3170368.
Дополнительные архивы чтения последовательности были восстановлены из Европейского архива нуклеотидов (ENA) с помощью enaBrowserTools (https://github.com/enasequence/enaBrowserTools). Сборки генома были загружены из NCBI и in silico преобразованы в 100 п.
н. sequence читает файлы с 50-кратным покрытием, используя самодельный скрипт Python.Считывания секвенирования были картированы на сборку предков B. anthracis Ames GCA_000008445 с эталонным геномом с использованием BioNumerics версии 7.6.3. Поскольку данные последовательности Ion Torrent страдают от относительно высокой частоты ошибок в инделках по сравнению с данными Illumina, мы разрешили информативное отображение (выравнивание с пробелами) для этого типа данных [30]. SNP вызывались в BioNumerics с использованием опции строго закрытого набора данных. После удаления дубликатов в настоящем исследовании было сохранено 673 записи, включая один штамм B. cereus, использованный в качестве внешней группы.Все оцененные архивы WGS перечислены в таблице S1. Минимальные остовные деревья были созданы с использованием BioNumerics, что позволяет создавать гипотетические недостающие ссылки. Агрегации SNP, потенциально отражающие гомологичные события горизонтального переноса генов (рекомбинация), были отысканы с помощью Gubbins [31].
ПЦР-диагностика образцов почвы, воды и аутопсии показало, что все образцы (n = 23), кроме почвы из оленеводческого стана (n = 5), содержали ДНК B.антрацис. Культуральную среду (агар GRM, селективную среду сибирской язвы, желточный агар или кровяной агар) засевали материалами из исследуемых образцов. Как правило, колонии, подобные B. anthracis, росли из всех ПЦР-положительных образцов, ни одной из ПЦР-отрицательных образцов. Наблюдение за этими культурами под микроскопом показало наличие цепочек грамположительных бацилл, покрытых капсулой. Все эти бациллоподобные колонии были положительными на B. anthracis методом ПЦР. Из этих образцов выросло несколько колоний посторонней микрофлоры.
Все образцы насекомых были ПЦР-отрицательными, колонии B. anthracis или посторонней микрофлоры выявить не удалось. Этот отрицательный результат может быть связан с использованием этанола для сохранения энтомологических образцов. Следовательно, мы не смогли подтвердить или опровергнуть потенциальную роль кровососущих насекомых в распространении болезни на большие расстояния.
Почва с места смерти, земля из лагеря, вода из близлежащего озера, шейный лимфатический узел, кровь из области шеи, кровотечение из заднего прохода и все клинические образцы были использованы в биотесте.Все мыши (за исключением мышей, зараженных почвой из лагеря) умерли с симптомами сибирской язвы на второй день после заражения, их селезенка и места инъекции содержали живые бактерии сибирской язвы, как показано при посеве на чашки Петри.
Генотипирование MLVA было применено, чтобы установить, циркулируют ли несколько генотипов в зоне эпидемии. Первоначально мы использовали локусы vrrA, Bams03, Bams05, Bams22, Bams44 и vntr23, полученные из схемы MLVA7, предложенной Thierry et al. [28]. Этот набор локусов позволил генотипировать все изоляты в течение одного дня с высокой степенью надежности и оказался очень полезным при проведении предварительного эпидемиологического расследования, когда требуется минимизировать время, затрачиваемое на анализ, вплоть до нескольких часов.
Впоследствии 25 локусов, описанных Lista et al. [32]. Одинаковый профиль MLVA наблюдался у всех штаммов, выделенных летом 2016 г. на Ямале, независимо от места изоляции (район озера Письото, Новопортовская тундра, район реки Еваяха) и учреждения, в котором анализировались образцы (S2 таблица ). Запрос базы данных MLVA Bacillus anthracis v4_1 на http://microbesgenotyping.i2bc.paris-saclay.fr [28] показал, что штаммы Ямала принадлежат к B-кладе [33].
Генотип MLVA25 Ямала отличался от всех генотипов, представленных в базе данных MLVA, по четырем или более локусам из 25 локусов. CanSNP-генотипирование [29] отнесло все ямальские штаммы к линии B.Br.001 / 002 в соответствии с отнесением на основе MLVA.
Обнаружение одного профиля MLVA25 позволило предположить, что один штамм циркулировал во время эпидемии, возможно, из уникального источника инфекции людей и животных. Ни один из штаммов в коллекциях SRCAMB и Ставропольского противочумного института (Референтный центр по борьбе с сибирской язвой) не показал одинаковый профиль MLVA25.
Мы выбрали четыре штамма, собранные в районе очага озера Писиото, для дальнейшей работы, включая полногеномное секвенирование (таблица 1).
| Название штамма | Источник |
|---|---|
| Ямал_2 | Шейный лимфатический узел мертвого оленя |
| Ямал_8 | Вода из озера |
| Ямал_10 | Почва возле мертвого оленя |
| Ямал_12 | Кожный карбункул больного |
Штаммы, перечисленные в таблице 1, были типичными по совокупности фенотипических свойств, но клинический изолят Ямал_12 изначально обладал лецитиназной активностью, в отличие от других изолятов.
После двух отрывков на твердых носителях эта активность пропала. Все отобранные изоляты были протестированы на вирулентность in vivo. Учитывая, что работа проводилась во время чрезвычайной ситуации, и что чрезвычайно важно было получить наиболее полные и надежные данные об исследуемых штаммах, в дополнение к мышиной модели были использованы морские свинки. Все изоляты были вирулентными, и не было обнаружено статистически значимых различий в их вирулентности (таблица S3).
Несколько колоний культивировали на селективном агаре сибирской язвы из образцов почвы, отобранных на глубине двух, трех и четырех метров.В отличие от этого, колонии не были извлечены из образцов почвы, собранных на глубине одного, пяти и шести метров. Выделенные колонии выглядели как колонии B. anthracis, не проявляли лецитиназной и гемолитической активности и были чувствительны к гамма-фагу.
Анализ ПЦР идентифицировал колонии как B. anthracis. MLVA-типирование с использованием семнадцати локусов (MLVA17) позволило выделить три генотипа, впоследствии названных 3Ya, 4Ya, 5Ya (таблица S2).
Генотип 4Ya был одинаково представлен в выборках с глубины два и три метра (табл. 2).Генотипы 3Ya и 4Ya различались по четырем локусам. Запрос базы данных MLVA B. anthracis показал, что оба они наиболее близки к штаммам, принадлежащим к кладе canSNP A.Br.008 / 009. Генотип 5Ya MLVA17 был идентичен генотипу MLVA17 Ямала. Эти штаммы были вирулентны для мышей, но не было обнаружено статистически значимых различий в их вирулентности (см. Таблицу S3)
| Глубина | Обнаруженные генотипы MLVA17 | Название репрезентативного генотипа штамма |
|---|---|---|
| 1 мес. | NA * | NA * |
2 мес. | 3Я, 4Я | ЛП50_3Я |
| 3 мес. | 4Я | LP51_4Я |
| 4 мес. | 5Я | LP53_5Я |
| 5 мес. | NA * | NA * |
| 6 мес. | NA * | NA * |
* NA — неприменимо
Анализ SNP всего генома Удивительно, но восстановленные генотипы MLVA были очень похожи на уже известные генотипы MLVA.Кроме того, генотип ямальского MLVA был идентичен одному из трех генотипов якутских штаммов. Наконец, мы восстановили три разных генотипа MLVA из одного и того же места в Якутии, тогда как вспышка на Ямале 2016 года была связана с уникальным генотипом, несмотря на его широкое географическое распространение. Простым объяснением этого наблюдения из якутских раскопок могло быть загрязнение при анализе образцов в SRCAMB.
Устойчивость эндоспор — хорошо известная причина случайных лабораторных заражений, о чем недавно вспоминали [34].Чтобы исследовать эту возможность, мы секвенировали четыре ямальских (таблица 1) и три якутских (таблица 2) штаммов вместе с четырьмя штаммами B. anthracis в коллекции SRCAMB, показывающими наиболее близкий генотип MLVA. Мы провели сравнение SNP-анализа полногенома этих одиннадцати геномов с общедоступными данными последовательности полных геномов 672 штаммов B. anthracis (таблица S1). S1 Рис. Показывает относительное положение ямальского и якутского штаммов в глобальной популяции B. anthracis, представленной выборкой из 42 особей B.сибирской язвы. Четыре ямальских штамма относятся к B.Br001 / 002 в соответствии с типированием canSNP. Якутский штамм LP53_Ya5 — ближайший сосед.
Рис. 1 — это крупный план B-клады, разделенной в линиях canSNP B.Br.CNEVA и B.Br.001 / 002 [33]. B.Br.CNEVA и B.Br.001 / 002 очень похожи с точки зрения расширения линии (длины ветви), за исключением быстро развивающейся подлинии B.
Br.001 / 002, наблюдаемой в Северной Америке, Бутане, Швеции и на юге страны. -Африка, в том числе суб-линия B.Br.Kruger.От корня B-клады до кончика самая длинная и самая короткая ветки определяются 449 и 77 SNP соответственно, что соответствует соотношению 5,8 в средней скорости расширения. B.Br.CNEVA наблюдалась в горных районах Западной Европы, тогда как штаммы B.Br.001 / 002 наблюдались на Ямале, Сибири, Эстонии (этот отчет), Корее [35] и Финляндии [36] в дополнение к быстрым линиям. географическое распространение. Ямальский и якутский штаммы LP53_5Ya принадлежат к одной подлинии, но четко разделены 65 SNP (83 SNP при оптимизации обнаружения SNP с акцентом на ямало-якутские штаммы, S2 рис).Возникает соблазн предположить, что быстро развивающееся происхождение, включая кладу Крюгера, является результатом очень успешного экспорта в Южную Африку, возможно, в результате европейской торговли по морским путям в средневековье или позже. Быстрая экспансия может также отражать присутствие гипермутаторного фенотипа [37], и для лучшего понимания филогеографии редкой B-клады потребуются дополнительные штаммы, раскрывающие новые промежуточные клоны.
Контрольный геном предка Эймса использовался для создания корней минимального остовного дерева (красная звезда). Длина ответвления линейно пропорциональна количеству SNP (масштабная линейка). Минимальное связующее дерево основано на 2123 SNP. Размер полученного дерева составляет 2125, что указывает на очень низкий уровень гомоплазии в соответствии с предыдущими сообщениями. Каждый кружок представляет одну деформацию. Цветовой код отражает происхождение внутри B-клада. Штаммы, ранее исследованные Sahl et al.имеют определенный цветовой код и названы согласно [38]. Самый длинный и самый короткий пути от корня до кончика показаны жирными линиями. Начиная с красной звезды, самая длинная линия определяется 449 SNP, тогда как самая короткая определяется 77 SNP, то есть соотношением 5,8. Теги включают название штамма и страну изоляции. Ямал, LP53_5Я Якут и ближайшие соседи из коллекции SRCAMB отмечены цветными метками.
Список штаммов и данные о последовательностях, использованные для построения рисунка, представлены в таблице S1.
Два других якутских штамма, LP50_3Ya3 и LP51_4Ya, принадлежат трансевразийской радиации TEA 008/011 [38]. TEA 008/011 — это замечательная политомия со звездообразной диаграммой направленности, состоящей из семи ветвей. На рис. 2 показано минимальное остовное дерево, основанное на полногеномных SNP, обнаруженных среди штаммов, отнесенных к TEA 008/011. Ветви названы так, как было предложено ранее [38]. Расстояние от корня до кончиков у разных линий различается в соотношении 6,39. Самая короткая ветвь с 31 SNP представлена штаммом A0245 из Турции.Самый длинный — 198 SNP — наблюдается у линии «Героин». Наиболее представлены линии передачи «Героин» [39–41], «СТИ» и «Цианковский» [38]. Линия «Героин» содержит один ранний раскол, три SNP из ядра политомии. Одна ветвь присутствует в Китае, тогда как другая ветвь является более сложной с точки зрения географического происхождения, поскольку она была изолирована во многих странах и включает штаммы, полученные от пациентов-людей, инфицированных при употреблении наркотиков.
Разница в длине не является результатом событий горизонтального переноса генов, поскольку ассоциированные SNP не демонстрируют доказательств кластеризации [31,42].Географическое происхождение штаммов, связанных с героином, неизвестно. Афганистан является вероятным вариантом, если заражение героином произошло в процессе производства наркотиков или первоначальной упаковки. Другими странами-кандидатами являются Турция и Пакистан, представленные штаммами, определяемыми короткими линиями, или дополнительные соседние страны, не представленные в текущих базах данных B. anthracis. Линия «STI» содержит три подлинии с ранним ветвлением. Первый определяется якутским штаммом LP51_4Ya, второй присутствует преимущественно в Китае, а третий соответствует штамму вакцины против ИППП из России.Вакцинный штамм Цианковского, штамм Свердлоск 1979 г. [38] и наиболее близкий к норвежскому штамму якутский штамм LP50_3Ya относятся к линии «Цианковский». Эта линия широко распространена в России и Восточной Европе, включая Грецию, Албанию, Болгарию, Польшу.
Линия «Пастер» содержит две подлинии с ранним ветвлением, одна обнаружена в Болгарии, а другая — в Италии, в дополнение к штамму вакцины Пастер I. Линии «A0150» и «A0245», названные здесь в соответствии с одним или двумя определяющими их штаммами, наблюдались в Турции.Последняя линия ведет к TEA Br011, соответствующей политомии A.Br.011 / 009, часто наблюдаемой во Франции и Италии [43, 44, 45]. Таким образом, в рамках политомии TEA 008/011 с семью ветвями обнаружено одиннадцать линий с ранним ветвлением, девять из которых имеют сильную географическую привязку к Турции (2), Китаю (2), России (2, включая Северную Якутию, Сибирь). ), Италии (2), Болгарии и Франции. Корень (красная звезда), определяемый точкой ветвления эталонного штамма предка Эймса, расположен в линии «Цианковский» на расстоянии одного SNP от центра политомии, соединяющей шесть других ветвей.Это может означать, что Европа является географическим источником политомии A.Br.008 / 011. Однако этот аргумент является слабым, и для установления географического происхождения политомии потребуется обширное секвенирование дополнительных штаммов A.
Br.008 / 011.
Цветовая кодировка отражает происхождение в пределах политомии A.Br.008 / 011 с использованием ранее определенной классификации [38]. Если известно, указывается географическое происхождение.Корень (красная звездочка) определяется с использованием эталонного генома предка Эймса. Включен один штамм, представляющий линию A.Br011 / 009. Длины ветвей по самому длинному и самому короткому пути от корня до кончика указаны (жирные ветви). Дерево основано на 1825 SNP, а уровень гомоплазии составляет 0,7% (размер дерева 1838). Список деформаций, использованных для создания рисунка, представлен в таблице S1.
Один представитель от A.Br.011 / 009 был включен на рис. 2. Корень шести ветвей A.Политомия Br.011 / 009 [43, 44] расположена вдоль этой ветви на расстоянии шести SNP от корня политомии A.Br.008 / 011. Политомия A.Br.011 / 009 возникла позже политомии A.
Br.008 / 011 [43, 44].
Сибирская язва является эндемическим заболеванием на большей части территории России, включая Ямал. В начале колонизации Ямала Российской империей в 17–18 вв. Регистрировались случаи заболевания. Первая вспышка была зафиксирована в 1760 году.С 1898 по 1931 год было описано 66 эпизоотий, во время которых, по оценкам, погибло более миллиона оленей. В 1940-х годах все поголовье оленей было вакцинировано, но в последующие годы количество вакцинированных животных было меньше. Например, в 1960-е годы было вакцинировано от 65 до 82% от общего поголовья оленей, что оказалось достаточным для предотвращения эпидемий. Таким образом был прерван многовековой цикл циркуляции сибирской язвы в тундрах Крайнего Севера [46].
Отсутствие вспышек свидетельствует о том, что почва в тундре была продезинфицирована и больше не содержала спор сибирской язвы.В 1968 г. было исследовано 360 проб почвы из мест массовой гибели оленей, и ни один из штаммов B.
anthracis выявить не удалось [47]. Это свидетельствует о том, что почвенные условия тундры (pH 3–5, содержание гумуса ниже 3%) неблагоприятны для поддержания жизнеспособности спор. В 2007 году вакцинация оленей была прекращена. В течение июня-июля 2016 года температура воздуха в зоне эпидемии Ямала была на 5–9 градусов выше нормы и не опускалась ниже 18 С. Температура почвы достигала 25 С на глубине 10 см и 7 С на глубине. глубина один метр.Это сочетается с очень небольшим количеством дождевых осадков [48]. По всей видимости, такой аномально теплый климат привел к таянию вечной мерзлоты, и жизнеспособные споры B. anthracis могли выйти на поверхность [3, 49].
По свидетельству оленеводов в эпидемической зоне у озера Писиото, стада из всех очагов инфекции прогнали через одно и то же место в тундре. Таяние вечной мерзлоты спровоцировало обвал холма на берегу реки. Это может объяснить обнаружение одного генотипа MLVA и wgSNP.К сожалению, поскольку все транспортные средства в районе использовались для перевозки людей и грузов, посетить и опробовать это место не удалось (в этом районе отсутствуют дороги, передвижение возможно только на санях с упряжкой оленей или на вертолете. ). Можно предложить два пути миграции возбудителя: вымывание бактериальных клеток из глубоких слоев почвы на поверхность земли или выход глубокого слоя почвы на поверхность в результате таяния и оползня. В то же время олени были ослаблены жарой, что могло повысить восприимчивость к инфекции.Наблюдения за очагом заболевания и опрос ветеринаров и оленеводов дали основание предположить, что заражение могло происходить не только спорами, но и вегетативными клетками. В нескольких случаях больной олень, который мог начать восстанавливаться и встать на ноги после приема однократной дозы антибиотика, впоследствии лизнул морду здоровых животных, которые заболели и умерли в течение 24 часов.
Следовательно, нельзя исключить одновременное распространение инфекции из нескольких изолированных очагов, вызванное исключительно жаркой погодой.Предшествующая крупномасштабная эпизоотия, широко распространенная в регионе и сохранившаяся в вечной мерзлоте во множестве очагов почвы, может объяснить наблюдаемую генетическую однородность штаммов, собранных во время нынешней вспышки.
На наш взгляд, этот вариант маловероятен, но, к сожалению, штаммы из предыдущих очагов не сохранились в коллекциях. Таким образом, невозможно сравнить штамм, выделенный в 2016 г., со штаммами, ранее циркулировавшими в регионе, и, соответственно, точно оценить продолжительность хранения спор патогена в почве.Учитывая, что последняя вспышка сибирской язвы на Ямале была зарегистрирована в 1941 году, вполне вероятно, что споры оставались жизнеспособными в почве не менее 75 лет.
Учитывая масштабы эпидемии и затраты на борьбу с ней, временной интервал между началом болезни северных оленей и началом противоэпидемических мероприятий может показаться слишком большим. Более быстрое реагирование могло бы позволить лучше контролировать эпидемию. В этой ситуации сыграло роль несколько факторов:
Наличие большого количества невакцинированных северных оленей (популяция оленей Ямала достигает 800 тысяч), подверженных заражению и ослабленных жарой.
Отсутствие опыта в диагностике сибирской язвы — последняя вспышка сибирской язвы в этом регионе была зарегистрирована в 1941 году, и местные ветеринары не знали об этой инфекции до 2016 года.
Кочевой способ разведения крупного рогатого скота — даже небольшое стадо может потреблять ограниченное количество тундра зарастает очень быстро, поэтому животноводам приходится перегонять стадо в другое место. Кочевое скотоводство охватывает гораздо большие территории, чем оседлое скотоводство. Маршруты миграции разных стад могут пересекать друг друга.В случае сибирской язвы это может быстро увеличить ареал эпидемии и способствовать заражению стада, мигрирующего через территории, куда гнали больных животных.
Установлению масштаба аварии и своевременному осмотру трупов мешало то, что оленеводы мигрировали и не всегда могли принести мертвых оленей для осмотра. Задержка в выявлении пациентов с сибирской язвой также объясняется недостаточной осведомленностью местного населения об опасностях сибирской язвы и о ее симптомах.Местные жители даже с симптомами кожной формы этого заболевания не обращали на них внимания и считали себя здоровыми. Эта ситуация возникла по ряду причин.
Традиционный образ жизни оленеводов, транспортная и коммуникационная изоляция кочевых оленеводов от городов связаны с более ограниченным доступом к медицинской помощи. Обычно высокая распространенность фурункулеза препятствовала своевременному выявлению поражений сибирской язвы на коже.
Все эти факторы способствовали распространению инфекции до того, как были предупреждены медицинские и ветеринарные организации.В скрытый период инфекция могла быть перенесена на транспорте (вертолеты и корабли) вместе с товарами и людьми, посетившими очаг, где в первую очередь произошло заражение животных. К сожалению, ретроспективно проследить перемещение людей и транспорта между очагами инфекции невозможно.
Возникновение вспышек сибирской язвы после 75-летнего перерыва показало, что решение о прекращении вакцинации было преждевременным, как и аналогичные независимые наблюдения в Грузии [50].Оказалось, что вечная мерзлота способна сохранять жизнеспособные споры микробов в течение длительного периода и служить резервуаром инфекции.
В благоприятных климатических условиях эти споры оказались способными мигрировать на поверхность почвы и инициировать новые циклы заражения.
Если ямальские штаммы были изолированы во время крупномасштабной эпидемии, то обнаружение якутских штаммов в, казалось бы, случайном месте очень примечательно. Ввиду отсутствия исторических данных о каких-либо вспышках сибирской язвы в этом районе не было никаких оснований ожидать обнаружения B.Anthracis в почве. Микробиологическое исследование было вызвано палеонтологической находкой пещерных львов, которая привела к случайной находке B. anthracis. Были охарактеризованы три различных генотипа из образцов почвы, взятых с глубины, соответствующей верхним слоям вечной мерзлоты, до четырех метров. Один генотип очень близок к генотипу Ямала и принадлежит кластеру B B. anthracis, тогда как два других принадлежат политомии A.Br.008 / 011.
Ориентировочно датируя появление A.Br.008 / 011 polytomy Монофилетическая, строго клональная эволюция B.
anthracis подразумевает, что весь вид произошел от уникального предка [51]. Иногда Африку называют «колыбелью» B. anthracis [52]. Сильнейшим аргументом в пользу такого происхождения может быть открытие в Африке дополнительных линий B. cereus, вызывающих сибирскую язву [51, 53, 54]. Однако это не помогает датировать или определять происхождение современных линий передачи, даже если эти линии имеют сильное географическое предпочтение.Предварительная датировка наиболее позднего общего предка (MRCA) вида B. anthracis 13 000–27 000 лет была ранее предложена на основе средней скорости мутаций и оценок циклов заражения в год [33].
Датирование узлов по филогенезу B. anthracis особенно сложно и сложно из-за неравномерности его эволюции из-за его экологии [33, 38, 55]. В отличие от других патогенов, таких как Mycobacterium tuberculosis [42, 56, 57], длина ветвей не коррелирует со временем, как было ранее исследовано и подробно обсуждено [34].Скорее всего, длина ветви отражает количество возможностей заражения в год [33] или, реже, мутаторный фенотип [37].
Ожидается, что это число увеличится, когда B. anthracis найдет благоприятную экологическую нишу. Каждый раскол в дереве отражает колонизацию нового экотипа, что позволяет закрепить дополнительную независимую линию. Обычно такое разделение происходит в результате географического распространения, и когда наблюдается значительная разница в длине ветвей, новый экотип может иметь самую длинную и быстро развивающуюся ветвь, отражающую прибытие в новую, наивную среду.В этом контексте политомия представляет собой исключительную возможность попытаться предложить точки датирования. Политомии возникают в результате внезапной колонизации множества новых экотипов, что может отражать исключительные изменения окружающей среды. Такие изменения могут иметь антропное происхождение, и может быть легче связать политомию с крупными историческими событиями. К настоящему времени у B. anthracis описаны две большие политомии: политомии A.Br.008 / 011 [38] и производные A.Br.011 / 009 [43]. Они составляют субклад «ТрансЕвразия» (ТЭА) [38].
В то время как подлинии A.Br.008 / 011 встречаются по всей Евразии, шесть кладов A.Br.011 / 009 наблюдаются в основном во Франции и Италии [43, 44,45].
Ветвление быстро развивающихся линий из одной и той же позиции в пределах уникальной подлинии политомии A.Br.011 / 009 в сторону Западной Африки и Северной Америки показало, что заражение было экспортировано из географически ограниченного региона, имеющего обмены одновременно с обоих континентов (Канада, Сенегал-Гамбия). Франция, семнадцатый век был предложен как наиболее вероятный пространственно-временной кандидат [44].На основании предложенной датировки была выдвинута гипотеза о предварительной датировке последнего предка политомии A.Br.011 / 009 четырнадцатым или пятнадцатым веком нашей эры [44].
В отличие от политомии A.Br.011 / 009, политомия A.Br.008 / 011 характеризуется значительным географическим распространением. Редкие линии с глубоким ветвлением наблюдаются в Европе (Италия, Болгария, Франция), а также в Турции, Китае и Якутии (штаммы вечной мерзлоты, настоящий отчет).
Есть одно важное событие в истории человечества до шестнадцатого века, которое могло бы объяснить такое распределение, — монгольские завоевания в течение тринадцатого века [58, 59].Чингисхан основал империю, простирающуюся от Северного Китая до восточного побережья Каспийского моря. Смерть Чингис-хана в 1227 году спровоцировала объединение армий Чингизидов для избрания Угедея новым ханом, а смерть Угедея в 1241 году в конечном итоге вызвала новое собрание в 1246 году. водоизмещение в десятки тысяч лошадей. Непосредственные преемники Чингис-хана вторглись в Европу до Венгрии в 1237–1242 годах и Анатолии (Турция) в 1241–1243 годах.Вторая попытка вторжения в Европу произошла в 1282–1283 годах, но потерпела серьезную военную неудачу [60].
Монгольская империя начала распадаться во второй половине 13 века. Несмотря на это, территория от Китая до Восточной Европы оставалась под властью Чингизидов, а Восточная Европа постоянно подвергалась набегам со стороны Золотой Орды с целью грабежа или просто присутствия воинских контингентов, участвовавших в войнах.
Таким образом, было создано общее политическое пространство, обеспечивающее относительно большие перемещения людей и животных между Азией и Европой, что могло бы в дальнейшем способствовать относительно быстрой и беспрепятственной передаче патогенов инфекционных заболеваний между этими регионами.Помимо военных операций, монголы организовали «ям», то есть цепочку ретрансляционных станций на определенных расстояниях друг от друга, что позволяло заменять лошадей для посыльных или самих посыльных и доставлять грузы и документы в течение нескольких недель на большие расстояния. Эта почтовая система также могла способствовать быстрому распространению инфекций, но в гораздо меньшей степени, чем массовые передвижения армий, управляемых лошадьми.
Присутствие чингизидов в европейском регионе прекратилось, когда русский царь Иван Четвертый (Иван Грозный) завоевал западные государства, образовавшиеся после раскола Золотой Орды, Казанского ханства в 1552 году, Астраханского ханства в 1556 году и Сибирского ханства.
Ханство в 1582–1598 гг.После этого единственным постмонгольским государством оставалось Крымское ханство, которое регулярно совершало набеги на Россию и Польшу (территории современных России, Украины, Белоруссии, Литвы, Латвии, Эстонии и Молдовы), пока не было завоевано Екатериной Великой. в 1783 году. Несмотря на активную рейдерскую политику Крымского ханства и постоянное использование татарских контингентов московскими царями в ходе постоянных войн в Восточной и Северной Европе, непрерывность миграционных путей кочевников из Азии в Европу была нарушена.
Следовательно, мы предполагаем, что здесь корень политомии A.Br.008 / 011 соответствует экотипу B. anthracis, присутствовавшему в монгольских армиях между первой половиной 13 -го века и серединой 16 -го век. Мы особенно отдаем предпочтение 13 -му веку как периоду, когда B. anthracis могли быть перенесены в короткие сроки животными, связанными с монгольскими армиями, особенно военными и ведущими лошадьми, во всех географических областях, охваченных глубокими ветвями линий А.
Политомия Br.008 / 011, т.е. из Восточной Азии (Китай) в Восточную Европу (Венгрия, Албания, Болгария). По истечении этого времени мы предполагаем, что раскол Монгольской империи значительно замедлил распространение инфекции.
В отличие от этой относительно точной гипотезы датировки, в настоящее время мы не видим никакого ключа к разгадке географического происхождения предка политомии A.Br.008 / 011. Заражение монгольской армии могло произойти во многих местах, от Восточной Европы до Восточной Азии.
Видимое противоречие между предполагаемой датировкой появления политомии A.Br.008 / 011 и образцов вечной мерзлоты Согласно предложенной гипотезе политомия A.Br.008 / 011 может быть консервативно датирована началом 13-х гг. века до середины 16 века. Отложение штаммов A.Br.011 / 008, включая штамм LP51_4Ya, извлеченных из вечной мерзлоты на глубине двух и трех метров, будет происходить после этого периода. Подлиния 3Ya даже более поздняя, относительная длина ветви меньше половины общей длины линии «Цианковский», к которой она принадлежит.
Пробы вечномерзлых грунтов Якутии были отобраны из аллювиальных (речных) отложений в широкой плоской долине с заливными озерами. Это, вероятно, соответствует голоценовым отложениям (возраст около 10 000 лет), замерзшим по мере накопления. Слой вечной мерзлоты образовался одновременно в Якутии и на Ямале 20–40 тысяч лет назад. Радиоуглеродный анализ других отложений, отобранных на берегу реки Уяндина и других местах Абыйского района на той же глубине, показал, что им 3–10 тыс. Лет [61].В среднем по Якутии глубина сезонного протаивания не превышает 2–2,5 метра. Поэтому мы ожидали, что штаммы B. anthracis, выделенные из вечной мерзлоты, будут значительно старше. Однако случайный характер исключительной палеонтологической находки в Якутии и извлечение палеонтологического материала и образцов почвы изыскателями, а не профессиональными палеонтологами или геологами, может быть причиной слабой геологической информации о слоях почвы, из которых были извлечены штаммы.Обнаружение B. anthracis было довольно неожиданным и было вызвано исследованием пещерных львов, и между раскопками пещерных львов и окончательным отбором образцов почвы прошел год.
Мы также внимательно изучили, в какой степени настоящие результаты могут быть результатом или затронуты загрязнениями различного типа. Однако вероятность того, что штаммы были внесены в исследуемые образцы почвы в результате загрязнения во время работы, весьма маловероятна. Перенос спор с поверхности маловероятен из-за отсутствия зарегистрированных случаев на месте отбора проб в последние десятилетия и ввиду отсутствия B.anthracis в верхнем (минус один метр) образце. Наиболее важно то, что первоначальная идентификация B. anthracis была произведена в лаборатории, не работающей с патогенными микроорганизмами и не поддерживающей такие коллекции штаммов. Загрязнение SRCAMB также очень маловероятно, поскольку для этого потребуется одновременное заражение тремя различными штаммами только в трех из шести образцов почвы. Кроме того, что наиболее убедительно, анализ последовательности всего генома штаммов из коллекции SRCAMB, показывающий схожий генотип MLVA, продемонстрировал, что это определенно разные штаммы.
Таким образом, можно сделать однозначный вывод. Мы искали присутствие спор B. anthracis на глубине шести метров, на глубине одного метра ниже поверхности до котят пещерного льва. Сохранность котят указывает на то, что тела и соответствующий слой вечной мерзлоты оставались замороженными в течение тысяч лет. В этих условиях наиболее скупым объяснением обнаружения штаммов B. anthracis только в верхних слоях является то, что B. anthracis не присутствовал в этом регионе на момент гибели котят 5000–10 000 тысяч лет назад.Скорее, B. anthracis появился бы относительно недавно в трех случаях, представленных тремя различными линиями. Это разнообразие не может быть результатом эволюции патогенов в почве. Три генотипа четко расположены в разных местах эволюционного древа B. anthracis. Таким образом, все три штамма, скорее всего, попали в почву и были сохранены в разное время, во время различных эпизоотий. Отсутствие четкой стратиграфии, то есть выделение изолятов, представляющих один генотип, из образцов почвы с разной глубины, и, что более важно, обнаружение спор ниже, чем ожидалось на основе предлагаемого датирования, означает, что микроорганизмы могут мигрировать в вечной мерзлоте.
.Это было бы совместимо с современными знаниями о вечной мерзлоте [62, 63].
Одним удивительным наблюдением в нашем исследовании является очень близкое генетическое родство ямальских изолятов с якутским штаммом LP53_5Ya, несмотря на большое расстояние (около двух тысяч километров), разделяющее эти два вида. локации. Несмотря на такую удаленность друг от друга, они расположены на одинаковой долготе, а расположенные в них экосистемы практически идентичны.В связи с этим можно предположить, что эти штаммы являются представителями некой «тундровой» популяции B. anthracis, распространенной на значительной территории Северной Евразии, по крайней мере, в прошлом. В этом случае циркуляция штаммов могла быть обеспечена миграцией популяций копытных, в первую очередь северного оленя.
Территория Якутии была заселена современными людьми как минимум с мезолита, но до начала 2-го тысячелетия нашей эры населяли исключительно племена охотников и рыбаков.
Первая популяция пастухов, предков современных якутов, переселилась сюда только в начале второго тысячелетия из Прибайкалья. Они были животноводами, занимались разведением крупного рогатого скота и лошадей. В Прибайкалье также разводят овец и верблюдов, но разводить их на территории Якутии невозможно из-за сурового климата.
Завоевание монголами Южной Сибири несколько увеличило миграционное движение из Прибайкалья. Племена домашних оленей, пришедшие с юга Сибири (Прибайкальский регион), к середине второго тысячелетия нашей эры (н.э.) достигли территории Западной Сибири, включающей полуостров Ямал, и север Восточной Сибири. Якутия.Эти племена из Прибайкалья были предками ненцев в Западной Сибири и эвенков в Восточной Сибири. Теоретически можно предположить, что в середине 2-го тысячелетия нашей эры те и другие могли контактировать в бассейне Енисея, южнее Таймыра, например, в Туруханском районе, откуда проходил путь на Ямал. возможно. В то время олени использовались в основном в качестве транспортных средств, а поголовье домашних оленей было небольшим.
До 17 века не было больших стад, максимальное поголовье в одном хозяйстве могло достигать ста голов оленей.Крупное оленеводство получило развитие только после заселения Сибири русскими, начиная с 17-18 веков. В настоящее время количество стад в одном хозяйстве достигает нескольких тысяч голов. Дополнительные сведения о штаммах B. anthracis, присутствующих в Северной Европе и Сибири, помогут лучше понять историю распространения B. anthracis среди северных оленей.
Только в середине 20 века в связи с началом массовой вакцинации оленей и введением ветеринарно-санитарного контроля возникли препятствия для бесплатного распространения B.anthracis в тундровой зоне. Однако, учитывая способность B. anthracis образовывать эндоспоры и наличие вечной мерзлоты, способной сохранять эти споры, еще больше увеличивая период их жизнеспособности, к этому времени могли образоваться множественные очаги почвы, разбросанные по обширной территории. Эта территория очень мало вовлечена в хозяйственную деятельность и крайне малонаселена.
Средняя плотность населения в Якутии составляет 0,3 человека на квадратный километр, при этом две трети населения проживает в городах, а плотность в сельской местности составляет около 0.1 человек на квадратный километр. Это делает невозможной не только санацию, но даже обнаружение и регистрацию таких очагов. События лета 2016 года на Ямале показали, что такие очаги сохраняют свой эпидемиологический потенциал в течение длительного времени и при благоприятных условиях, в первую очередь при таянии вечной мерзлоты из-за локального или глобального потепления, могут стать источником инфекции, вызывая крупномасштабные эпидемии, приводящие к человеческим жертвам и значительным экономическим затратам. Реактивированный фокус может оставаться активным в течение нескольких лет.В 2017 г. протестировано 32 пробы из зоны эпидемии Ямала-2016. В двух образцах — золе с места сгоревшей туши оленя (лат. N68.24010, лон. E71.01.200) и биологическом материале с не полностью сгоревшей туши оленя (лат. N68.24989, лон.
E70.44435) — содержалась ПЦР обнаруживаемая ДНК B. anthracis. В обоих образцах можно было культивировать вирулентные бактерии. Генотип MLVA был идентичен штаммам, ранее выделенным в зоне эпидемии в 2016 г. [64].
Если бы споры могли сохранять жизнеспособность в течение года на поверхности почвы, то вряд ли можно сомневаться в том, что во время сезонного таяния снега они могли бы распространиться на большую территорию и проникнуть в почву на неожиданную глубину.Таким образом, в тундровых районах, где хотя бы один раз была зафиксирована вспышка сибирской язвы, представляется необходимым постоянно проводить противоэпидемические мероприятия, такие как вакцинация скота и пастухов, а также поддерживать готовность медицинских и ветеринарных учреждений к диагностике. сибирской язвы и экстренные меры по выявлению болезни.
Последние: Положительные результаты теста в китайской провинции Хэбэй
ПЕКИН — Китайские органы здравоохранения заявляют, что в провинции Хэбэй, граничащей со столицей Пекином, у многих людей положительный результат теста на коронавирус.
Вспышка, сосредоточенная в городах Хэбэй Шицзячжуан и Синтай, является одной из самых серьезных в Китае за последние месяцы и происходит на фоне мер по сдерживанию дальнейшего распространения болезни во время новогодних праздников по лунному календарю в следующем месяце. Власти призвали граждан не путешествовать, приказали закрыть школы на неделю раньше и провели массовое тестирование.
Национальная комиссия здравоохранения заявила в понедельник, что еще 82 человека дали положительный результат в провинции Хэбэй и показали симптомы. По всей стране еще 36 человек дали положительный результат без проявлений симптомов, хотя не сразу было ясно, сколько из них были в Хэбэе.
Два других случая были зарегистрированы в северо-восточной провинции Ляонин и один в Пекине, где более 30 человек заболели в результате вспышки, сосредоточенной в северо-восточном районе Шуньи. Жилые комплексы в районе требовали доказательств недавнего отрицательного теста на коронавирус от всех, кто хотел войти.
В Китае зарегистрировано 87 536 случаев заболевания, 4634 человека умерли. Больницы лечили 673 человека от COVID-19, в то время как 506 человек находились в изоляции и под наблюдением после положительного теста без симптомов.
Вспышка болезни в Хэбэе вызвала особую обеспокоенность из-за близости провинции к столице страны. Некоторые части провинции заблокированы, а поездки между провинциями в значительной степени отрезаны: тем, кто въезжает в Пекин на работу, необходимо предъявить подтверждение работы и справку о состоянии здоровья.
Хэбэй зарегистрировало 265 подтвержденных случаев и не менее 181 бессимптомных случаев за последние восемь дней. Китай не включает тех, у кого положительный результат теста, но у которых нет симптомов, в официальном подсчете случаев заболевания.
И Шицзячжуан, и Синтай заказали миллионы проверок, остановили общественный транспорт и ограничили жителей своих общин или деревень на одну неделю.
___
ВСПЫШКА ВИРУСА:
— Калифорния сообщает о рекордном количестве смертей от коронавируса 695 за один день
— Премьер-министр Великобритании Борис Джонсон подвергается критике, поскольку Британия снова сталкивается с натиском COVID-19
— Переполненные больницы в Украине видят последствия массовых новогодних праздников
— Израильтяне протестуют против Нетаньяху в связи с третьим вирусом
— В Квебеке действует ночной комендантский час на случай пандемии
___
Следите за репортажем AP на https: // apnews.
com / hub / coronavirus-pandemic, https://apnews.com/hub/coronavirus-vaccine и https://apnews.com/UnderstandingtheOutbreak
___
ЗДЕСЬ, ЧТО ЕЩЕ ПРОИСХОДИТ:
НАШВИЛЛ, Теннесси — Конгрессмен США Чак Флейшманн из Теннесси заявил в воскресенье, что у него был положительный результат на коронавирус после контакта с другим членом Конгресса, с которым он живет в одной резиденции в Вашингтоне, округ Колумбия.
Флейшманн заявил в своем заявлении в Twitter, что находится на карантине с вечера среды, когда узнал, что у другого человека был положительный результат теста.
Флейшманн сказал, что «чувствует себя хорошо», и консультируется с лечащим врачом Капитолия.
В ноябре республиканец выиграл свой шестой срок в Палате представителей США от 3-го округа Конгресса на юго-востоке Теннесси.
___
МЕКСИКА — Пресс-секретарь президента Мексики Андрес Мануэль Лопес Обрадор заявил в воскресенье, что у него положительный результат на коронавирус, но не было информации о том, был ли тестирован президент.
Хесус Рамирес Куэвас написал в своем Twitter-аккаунте: «У меня хорошее здоровье, и я буду работать из дома.”
Рамирес Куэвас близок к Лопесу Обрадору, часто передает ему документы или отправляется в поездки с президентом.
Лопесу Обрадору 67 лет, у него высокое кровяное давление, но он почти никогда не носит маску.
В воскресенье Лопес Обрадор совершил поездку в морской порт Мансанильо на тихоокеанском побережье и выступил с речью, как обычно, без маски.
___
ТОКИО. Министерство здравоохранения Японии обнаружило у людей, прибывающих из Бразилии, вариант коронавируса, отличный от такового в Великобритании и Южной Африке.
Этот вариант был обнаружен в ходе испытаний в аэропорту у мужчины в возрасте 40 лет, женщины в возрасте 30 лет и двух подростков, сообщило министерство в воскресенье. Япония работала с другими странами, ВОЗ и другими медицинскими экспертами над анализом новой версии вируса, и все еще было неясно, подействуют ли имеющиеся вакцины.
Мужчина с положительным результатом теста не имел никаких симптомов по прибытии, но был госпитализирован после того, как ему стало трудно дышать. По данным министерства, у женщины болела голова, у одного подростка, мужчины, была лихорадка, а у другой девушки-подростка не было никаких симптомов.
Около 30 случаев вариантов из Великобритании и Южной Африки ранее было зарегистрировано в Японии. Эксперты обеспокоены тем, что варианты распространяются быстрее.
Япония объявила чрезвычайное положение в районе Токио, которое началось в пятницу и потребовало, чтобы рестораны и бары закрылись в 20:00. Некоторые жаловались, что этого недостаточно, отмечая, что вокзалы и закусочные все еще переполнены, в том числе ночью.
В Японии на сегодняшний день зарегистрировано около 4000 смертей, связанных с COVID-19, и более 280000 подтвержденных случаев.
___
ЙОХАННЕСБУРГ. По данным Африканских центров по контролю и профилактике заболеваний, в воскресенье Африка преодолела рубеж в 3 миллиона подтвержденных случаев COVID-19, в том числе более 72000 смертей.
На Южную Африку приходится более 30% общего числа случаев на континенте, где зарегистрировано более 1,2 миллиона случаев заболевания, в том числе 32 824 случая смерти. Высокая доля случаев заболевания в Южной Африке может быть связана с тем, что в этой стране проводится больше тестов, чем во многих других африканских странах.
Южная Африка борется с повторной вспышкой болезни, вызванной более заразным и быстро распространяющимся вариантом вируса. Многие больницы выходят на полную мощность, но ожидается, что число инфицированных продолжит расти, по мнению экспертов в области здравоохранения.
Ежедневное скользящее среднее число новых случаев в Южной Африке за последние две недели выросло с 19,86 новых случаев на 100 000 человек 26 декабря до 30,18 новых случаев на 100 000 человек 9 января, согласно данным Университета Джона Хопкинса.
Президент ЮАР Сирил Рамафоса встретится со своим кабинетом на этой неделе, чтобы обсудить, следует ли принять дополнительные ограничения, чтобы замедлить распространение болезни, одновременно уравновешивая необходимость поощрения экономического роста.
___
БАЛТИМОР — Коронавирусные инфекции превысили 90 миллионов подтвержденных случаев по всему миру, поскольку все больше стран готовятся к более широкому распространению более вирулентных штаммов болезни, от которой сейчас погибло почти 2 миллиона во всем мире.
Согласно воскресным данным Университета Джона Хопкинса, число инфекций во всем мире удвоилось всего за 10 недель.Еще в конце октября заражение COVID-19 достигло 45 миллионов.
По состоянию на полдень воскресенья Джон Хопкинс насчитал 90 005 787 случаев заражения по всему миру.
Соединенные Штаты, в которых в настоящее время зарегистрировано более 22,2 миллиона случаев инфицирования, возглавляют мир с самым высоким числом инфекций, зарегистрированным с начала глобальной пандемии. Число случаев заболевания в США более чем вдвое превышает число случаев в Индии, где зарегистрировано почти 10,5 миллиона случаев заражения.
___
МОСКВА — Высокопоставленный чиновник здравоохранения сообщил, что в России был обнаружен высокоинфекционный вариант нового коронавируса.
Анна Попова, врач, возглавляющая Роспотребнадзор, государственное агентство по защите здоровья человека, заявила в воскресенье по государственному телевидению, что этот вариант был обнаружен у одного пациента, который вернулся в страну из Великобритании, где он широко распространился.
Всего в России зарегистрировано около 3,4 миллиона случаев заражения и 61 800 случаев смерти. С начала 2021 года количество новых случаев заражения и смертельных случаев ежедневно снижается.
___
ПРАГА — Тысячи разгневанных протестующих собрались в чешской столице, чтобы выразить протест против ограничительных мер правительства, введенных для сдерживания пандемии коронавируса.
Демонстранты, представляющие различные бизнес-группы, художников, учителей, врачей и профсоюзы, осудили ограничения, назвав их хаотичными, неэффективными и вредными для страны.
Многие пообещали открыть свой бизнес, несмотря на текущую строгую изоляцию.
По оценкам полиции, в воскресенье на мирную акцию протеста на Староместской площади в Праге пришло около 3000 человек.
У демонстрантов не было масок, и они игнорировали правила социального дистанцирования.
Бывший президент Вацлав Клаус, последовательный критик реакции правительства на пандемию, обратился к толпе.Клаус говорит, что ограничения ничему не помогают и разрушают жизни людей и экономику.
В Чешской Республике было подтверждено 831 165 случаев заболевания, из которых 13 115 умерли.
___
ИЕРУСАЛИМ — Премьер-министр Израиля лично приветствовал новую партию вакцин против коронавируса Pfizer-BioNTech в страну.
Биньямин Нетаньяху стремится сделать Израиль первой страной, которая вакцинирует свое население. Всего за три недели Израиль уже ввел первую из двух доз вакцины почти 20% своего населения.Он также согласился поделиться данными кампании с Pfizer в надежде помочь другим странам положить конец пандемии.
На небольшой церемонии в главном международном аэропорту Израиля в воскресенье Нетаньяху сказал, что Израиль обеспечил достаточное количество вакцин для вакцинации взрослого населения к концу марта.
Это будет примерно во время парламентских выборов 23 марта.
Нетаньяху ставит агрессивную вакцинацию во главу угла своих надежд на переизбрание. Ввязанный в жесткую гонку, он, похоже, рассчитывает, что успешная кампания по вакцинации убедит избирателей забыть о судебном процессе над его коррупцией и об экономическом ущербе, нанесенном повторными блокировками от коронавируса.
Израиль ужесточил ограничения на изоляцию в выходные дни, что, по словам Нетаньяху, является «последней попыткой» остановить бушующую вспышку.
В Израиле зарегистрировано более 487000 случаев заражения коронавирусом и более 3650 смертей с момента возникновения пандемии весной.
___
РИМ — В воскресенье в Италии зарегистрировано 18 627 новых случаев заболевания COVID-19, в результате чего число подтвержденных случаев коронавирусной инфекции в стране в результате пандемии достигло 2276 491 человек.
По данным Министерства здравоохранения, с предыдущего дня был зарегистрирован 361 случай смерти пациентов с COVID-19, что увеличило общее известное число погибших до 78,755.
Последние случаи заражения последовали за периодом ограничений на праздничные дни в конце года, включая ограничения на поездки жителей, но с некоторыми льготами для посещения семьи или друзей.
С понедельника Италия возвращается к трехуровневой системе с ограничениями экономической и социальной активности, определяемыми тем, как обстоят дела в каждом регионе с точки зрения уровня заражения, наличия коек в отделениях интенсивной терапии и других факторов.
В стране с населением около 60 миллионов человек более полумиллиона человек с положительным диагнозом в настоящее время изолируются дома, а около 26 000 находятся в больнице.В период первоначального всплеска пандемии в результате более чем двухмесячных жестких общенациональных мер изоляции число новых инфекций и смертей в конечном итоге резко снизилось.
Но после меры были в значительной степени ослаблены в течение лета, случаи быстро снова начала расти и остался неизменно высоким числом.
___
ФЕНИКС — Аризона остается горячей точкой США для COVID-19, и в воскресенье представители здравоохранения сообщили о более чем 11000 новых случаев заражения третий день подряд и еще 105 смертельных случаях.
Это увеличило мрачные цифры штата до 618 546 случаев и 10 141 известного случая смерти с начала пандемии. В воскресенье официальные лица Министерства здравоохранения штата Аризона сообщили об 11021 новом случае COVID-19.
В пятницу было зарегистрировано 11 650 случаев заболевания и еще 197 случаев смерти, 11 094 дополнительных случая и 98 смертей в субботу.
По состоянию на субботу, штат Аризона был вторым по величине заболеваемости коронавирусом и уровнем смертности на душу населения в стране за последние семь дней, согласно данным U.S. Центры по контролю заболеваний.
___
ЛОНДОН — Тысячи людей в возрасте 80 лет и старше начали получать приглашения на вакцинацию от коронавируса в Англии, заявили официальные лица в воскресенье, поскольку Великобритания наращивает свою национальную программу вакцинации, стремясь достичь своей цели по вакцинации около 15 миллионов человек к середине Февраль.
На этой неделе по всей Англии должно прибыть более 600 000 приглашений с просьбой к пожилым людям записаться на уколы в новых центрах массовой вакцинации поблизости.
На данный момент правительство ввело первую дозу вакцины более чем 1,2 миллионам человек.
Семь новых крупных центров вакцинации присоединяются к примерно 1 000 других объектов по всей стране, включая больницы, клиники общей практики и некоторые аптеки.
Чиновники надеются, что скорейшее массовое развертывание вакцинации поможет вывести Великобританию из третьего национального карантина, который был приказан в этом месяце для сдерживания тревожной волны инфекций и смертей от COVID-19.По данным Университета Джонса Хопкинса, в Великобритании от пандемии погибло 81000 человек.
___
БЕРЛИН — В Германии от COVID-19 умерло более 40 000 человек.
Печальный рекорд в 40 343 смертельных случая был достигнут в воскресенье, когда национальный центр по борьбе с болезнями сообщил о 465 новых случаях смерти.
Изначально Германии удавалось поддерживать низкий уровень смертности по сравнению со своими европейскими соседями, но с октября как новые инфекции, так и смертность неуклонно растут.
В воскресенье в Германии зарегистрировано 16 946 новых случаев заражения.
В прошлом месяце в стране была введена вторая жесткая блокировка, которая недавно была продлена до конца января. Школы и большинство магазинов закрыты, больницы в стране находятся на пределе возможностей, а в некоторых моргах не хватает места, чтобы охладить непрекращающийся поток прибывающих тел.
Канцлер Германии Ангела Меркель предупредила, что ближайшие недели будут самыми трудными в период пандемии. Однако канцлер также сказал, что массовые вакцинации, которые начались в конце декабря, в конечном итоге принесут облегчение.
«Привито несколько сотен тысяч человек, и с каждым днем их будет становиться больше. Скорость будет расти », — заявила Меркель в своем еженедельном подкасте.
Германия и Европейский Союз на данный момент одобрили вакцины Pfizer-BioNTech и Moderna. К субботе вакцинацию прошли более 530 000 человек, в основном пожилые люди и медицинский персонал.
___
ЛЬВОВ, Украина — Медицинский колледж на западе Украины был преобразован во временную больницу, поскольку коронавирус наводняет восточноевропейскую страну.
Фойе колледжа во Львове вмещает 50 коек для пациентов с COVID-19, еще 300 размещены в лекционных залах и аудиториях для размещения большого количества людей, обращающихся за помощью в переполненную больницу скорой помощи поблизости.
Заведующая терапевтическим отделением больницы Марта Сайко сообщила, что помещения колледжа удвоили лечебные возможности. Она надеется, что введенная в пятницу широкомасштабная изоляция снизит нагрузку на украинскую систему здравоохранения.
Многие медицинские работники критиковали правительство за то, что оно отдало приказ о запрете только после Рождества и Нового года, вместо того, чтобы рисковать рассердить общественность.
«Масштабные новогодние гулянья мы видели практически в каждом городе», — сказал Борис Рыбун, начальник областного патологоанатомического бюро Львова. «Думаю, будут последствия. Мы увидим их через неделю или две ».
Встреча с врио губернатора Пермского края Дмитрием Махониным • Президент России
В начале встречи Президент отметил, что Пермский край — один из крупнейших промышленных центров России:
он занимает 16 -е место в стране по объему промышленного производства на душу населения.
В регионе решается много вопросов в интересах России, но еще предстоит решить массу собственных проблем.
Для начала, Махонин Махонин ДмитрийГубернатор Пермского края доложил Президенту, что ситуация с коронавирусом стабильна. Область занимает 75 место место. в количестве инфицированных на 100000 человек. Все требования Роспотребнадзора наблюдается.
По экономике, промышленному производству индекс снизился на 2,5 процента. Это немного лучше, чем в среднем по стране.В то же время Пермский край может похвастаться достижениями: строительство выросли на 11 процентов, сельское хозяйство — примерно на 3 процента, текстильная промышленность — на 50 процентов. В области сформирован инвестиционный пакет из 80 проектов на общую сумму 1,5 млн. трлн руб. Эти проекты подтверждены, и их реализация может создать 10 000 новых рабочих мест.
Временно исполняющий обязанности губернатора области отметил, что
в 2023 году в области завершится строительство нового завода по производству
Ракетные двигатели РД-191.
Освоено производство авиадвигателей ПД-14,
и реализует проект по сборочно-испытательному комплексу нового
Двигатель ПД-35.В регионе изучаются возможности дальнейшего развития двигателя.
строительный кластер. Таким образом, можно подумать о создании специализированного двигателестроения.
центры гражданской и военной авиации.
Г-н Махонин попросил Президента поручить Минпромторгу и Ростеху рассмотреть возможность развития предложенного кластера. Регион возьмет на себя обязательство по построению всех социальных объекты инфраструктуры — школы, детские сады и жилье.
Исполняющий обязанности губернатора упомянул Президентскую
Указ о праздновании 300 -го -летия города Перми в 2023 году
Добавив, что регион, конечно же, готовится к мероприятию.Есть несколько
далеко идущие планы, такие как ремонт главных улиц, общественных мест,
парки, объекты культуры, медицинские учреждения и дорожная инфраструктура. Общий,
Будет вложено 140 миллиардов рублей. Пермский край включен в федеральную целевую инвестиционную программу строительства новой сцены Пермской оперы.
и Театр балета.
Обсуждение коснулось и развития транспортной инфраструктуры, в частности, покупка новых автобусов и трамваев.
Дмитрий Махонин также просил Президента дать поручение Минфину и Минтрансу о включении строительство моста через Каму, что важно для Перми, в их планах по модернизации и расширению магистральной инфраструктуры Российской Федерации и выделить федеральное финансирование на 2025–2026 годы.
Еще один запрос исполняющего обязанности губернатора касался проекта строительства нового помещения для Пермской картинной галереи. Региона крупнейший склад художественных ценностей содержит уникальную коллекцию деревянных скульптуры пермских богов, уникальное собрание строгановских икон и картины передвижников. На существующих выставочных площадях не может быть больше 1,5. процент от сбора.
По просьбе Президента выступил Дмитрий Махонин. Подробнее о реализации нового авиадвигателя ПД-35 проект.
Владимир Путин согласился, что все вопросы
были подняты были важны, и что заинтересованные учреждения и правительство получат
необходимые инструкции по их устранению.
Это касается транспорта
инфраструктура, мосты и учреждения культуры.
Президент также указал на некоторые проблемы которые требуют личного участия исполняющего обязанности губернатора. Один из них — безработица, что немного выше, чем в среднем по России сегодня в Пермском крае, и значительная часть ветхого и непригодного жилья.
При этом Президент отметил, что Пермь имеет благоприятную среду для роста: растет ВРП, производственные производство, сельскохозяйственное производство, жилищное строительство и другие виды строительства поддерживаются на должном уровне, а региональные финансы в хорошем состоянии условие.
Что касается ПД-35, то, по словам Владимира Путина, это
— важный проект не только для Пермского края и не только для двигателестроения — это еще и очень важный проект для России как страны с ее амбициозными планами по развитию авиастроительной отрасли,
в том числе новый широкофюзеляжный самолет.Правительство окажет поддержку проекту двигателя и создаст необходимые условия для производства, в том числе новый испытательный стенд, для стендовых испытаний, а также выделит финансирование.