Реестр санитарно эпидемиологических заключений: Sorry, this page can’t be found.

Сила молекулярных методов в эпидемиологических исследованиях хорошо проиллюстрирована несколькими примерами. PulseNet, национальная сеть молекулярных подтипов для эпиднадзора за болезнями пищевого происхождения, была создана CDC и несколькими департаментами здравоохранения штатов в 1996 году для облегчения выделения подтипов бактериальных патогенов пищевого происхождения в эпидемиологических целях. Двадцать лет назад большинство вспышек болезней пищевого происхождения были локальными проблемами, которые обычно возникали в результате неправильного обращения с пищевыми продуктами. Вспышки часто были связаны с отдельными ресторанами или общественными мероприятиями и часто попадали в поле зрения местных органов здравоохранения по звонкам от пострадавших.Сегодня вспышки болезней пищевого происхождения обычно связаны с широко распространенными пищевыми продуктами, которые перед распространением заражаются, в результате чего случаи заболевания распространяются на несколько штатов или стран. Сеть PulseNet, которая началась с 10 лабораторий, типирующих один патоген (Escherichia coli O157: H7), выросла и теперь включает 46 государственных и две местные лаборатории общественного здравоохранения, а также лаборатории по безопасности пищевых продуктов Управления по контролю за продуктами и лекарствами США (FDA). ) и Министерством сельского хозяйства США (USDA). ²⁸ В настоящее время четыре патогена пищевого происхождения (E. coli O157: H7, нетифоидные серотипов Salmonella , Listeria monocytogenes и Shigella) подтипируются PFGE в рамках планового эпиднадзора за болезнями пищевого происхождения. Лаборатории следуют стандартизированному протоколу с использованием аналогичного оборудования, чтобы результаты были хорошо воспроизводимыми, и можно было сравнивать образцы ДНК, полученные в разных лабораториях. Изоляты делятся на подтипы на регулярной основе, а данные оперативно анализируются на местном уровне.Кластеры часто можно обнаружить локально, которые невозможно было бы идентифицировать только традиционными эпидемиологическими методами. Образцы PFGE распределяются между участвующими лабораториями в электронном виде, что служит для связи явно не связанных друг с другом вспышек и облегчает идентификацию общего носителя. ³¹ Например, в мае 1998 года PulseNet содействовала исследованию двух кластеров E. coli O157: H7 в северо-восточной части США, где были сняты отпечатки PFGE изолятов E. coli O157: H7 лабораториями PulseNet в этом регионе. выявили два одновременных кластера E.coli O157: H7 (32 изолята в четырех из пяти штатов с одним паттерном PFGE и 25 изолятов во всех пяти штатах со вторым паттерном), один из которых можно проследить до двух супермаркетов, которые получали говяжий фарш от одного и того же поставщика. Без молекулярного типирования эпидемиологам было бы трудно идентифицировать случаи, связанные с каждым кластером. С другой стороны, использование подтипов PFGE в рамках рутинного эпиднадзора имеет преимущества, выходящие за рамки обнаружения вспышек. Например, временная кластеризация несвязанных случаев не является редкостью, и без молекулярного типирования ценные ресурсы общественного здравоохранения были бы потрачены впустую на расследование псевдо-вспышек.

Другой пример силы молекулярных методов при проведении эпидемиологического расследования связан со случаем передачи ВИЧ медицинским работником. В расследовании участвовала молодая женщина, которая заразилась СПИДом, хотя у нее не было выявленных факторов риска. В ходе расследования выяснилось, что 2 года назад ей удалил несколько зубов дантист, у которого впоследствии был подтвержден СПИД. Ретроспективное исследование случай-контроль было проведено с участием дантиста и его бывших пациентов, чтобы оценить возможность передачи инфекции от стоматолога пациенту.Пациентов опрашивали, чтобы установить известные факторы риска передачи ВИЧ. Также была оценена практика инфекционного контроля в стоматологическом кабинете. ³² Восемь ВИЧ-инфицированных были выявлены из группы из более чем 1000 бывших пациентов стоматолога. Пять из восьми пациентов не имели факторов риска или других задокументированных контактов с ВИЧ. Несмотря на то, что все пятеро прошли инвазивные процедуры и четыре из пяти общих дней посещения, не удалось установить какой-либо идентифицируемый механизм передачи с помощью традиционной методологии контроля случаев. ³² Однако сравнение нуклеотидных последовательностей нескольких участков гена gp120 штаммов ВИЧ у стоматолога, ВИЧ-положительных пациентов (с известными факторами риска и без них) и 35 ВИЧ-инфицированных контрольных групп населения установило вероятность распространенный источник инфекции. ³³ Генетическое расстояние вирусов от пяти пациентов без известных факторов риска и вируса от стоматолога составляло 3,4–4,9%, что аналогично тому, что ранее было обнаружено с вирусами ВИЧ от людей с эпидемиологически связанными инфекциями.Напротив, изоляты от пациентов с известными факторами риска были более отдаленно связаны (> 10%) с вирусом ВИЧ, полученным от стоматолога. ³³ Среднее генетическое расстояние вирусов от пяти пациентов и контрольной группы населения составляло приблизительно 11%, что практически идентично среднему расстоянию между 35 вирусами ВИЧ и контрольной группой. Анализ филогенетического дерева подтвердил, что вирусы ВИЧ от дантиста и пяти пациентов образуют тесно связанный кластер. ³³

4.Устранение угроз: выводы и рекомендации | Микробные угрозы здоровью: появление, обнаружение и ответ

угрожающих вида человека имеют зоонозное происхождение. За последние 10 лет миру пришлось отреагировать на вирус Sin Nombre и другие хантавирусы от грызунов, вирус Nipah от летучих мышей через свиней, вирусы гриппа от водных птиц и вирус Западного Нила от птиц через комаров. Зоонозы также возникают, когда домашние животные служат их резервуарами.Как обсуждалось ранее, устойчивые к противомикробным препаратам организмы возникли отчасти в результате использования противомикробных препаратов в сельском хозяйстве для профилактики заболеваний и стимулирования роста кур, свиней, крупного рогатого скота и даже рыб и моллюсков. Действительно, сибирская язва, использованная в качестве возбудителя биотерроризма в 2001 году, является естественным зоонозом. Уязвимость Соединенных Штатов и развитых стран перед агротеррористическими атаками с использованием таких агентов, как вирус ящура, и высокие социально-экономические издержки болезней домашнего скота можно было бы лучше решить с помощью междисциплинарного подхода к микробным угрозам.Совершенно необходимо, чтобы специалисты в области наук о человеке, животных, сельского хозяйства и окружающей среды объединились для изучения таких угроз.

Наше понимание многих недавних угроз болезней исходило в основном от ученых, которые работают дома, в лаборатории, в клинике или в полевых условиях. Эти ученые обычно прошли формальную подготовку в одной медицинской / биомедицинской / ветеринарной дисциплине, но получили дополнительную подготовку и опыт в других дисциплинах, имеющих отношение к профилактике заболеваний и борьбе с ними.Дисциплинарная база этого коллектива ученых была удивительно разнообразной, включая клиническую медицину, ветеринарию, микробиологию, вирусологию, молекулярную биологию, патологию, иммунологию, токсикологию, эпидемиологию, общественное здравоохранение, маммологию, биологию дикой природы, медицинскую энтомологию и экологию. Некоторые из этих ученых также обладали ценным профессиональным опытом в таких областях, как эпидемиологическое моделирование, ГИС и технологии дистанционного зондирования, санитарное просвещение, администрация и менеджмент, а также государственная политика.Другие соответствующие дисциплины включают экономику, антропологию и этику.

Эти кадры ученых предоставили бесценные знания и навыки для решения многодисциплинарного характера борьбы с инфекционными заболеваниями. Более молодые коллеги все больше полагаются на молекулярные подходы и компьютерные инструменты и часто не имеют подготовки и опыта в основных дисциплинах, наиболее важных для профилактики и контроля инфекционных заболеваний, таких как полевые эпидемиологические наблюдения и исследования. К сожалению, сегодня слишком мало ученых, которые могут использовать все различные инструменты и подходы, которые могут быть полезны при обнаружении, диагностике, расследовании, профилактике и борьбе с возникающими инфекционными заболеваниями.

Эти проблемы характерны не только для инфекционных болезней. В прошлом одним из решений было создание центров междисциплинарного мастерства, что, возможно, лучше всего иллюстрируют центры исследований рака, которые оказались бесценными для достижений в области профилактики и лечения рака.Дания удовлетворила потребность в междисциплинарном подходе к решению возникающих инфекционных заболеваний-

Джон Сноу — отец эпидемиологии

Холера — инфекционное заболевание, которое стало серьезной угрозой для здоровья в 1800-х годах. Эта история изящно рассказана в книге The Ghost Map Стивена Джонсона, который описывает условия в Лондоне в ситуации 1800-х годов в кратком видео ниже.

Холера по-прежнему является проблемой во всем мире (см. Холера на Гаити). В следующем видео рассказывается об эпидемии холеры на Гаити в 2010 году.

В 1800-х годах в Европе и Америке были крупные эпидемии холеры, унесшие жизни тысяч людей. Джон Сноу (показан ниже) был лондонским врачом, который несколько десятилетий систематически изучал холеру. Чаще всего ему приписывают решение вспышки холеры, произошедшей в Лондоне в 1854 году (вспышка описана ниже), но его исследования холеры были гораздо более обширными, чем это.Первая эпидемия холеры в Лондоне разразилась в 1831 году, когда Сноу был еще учеником. Еще одна крупная эпидемия произошла в 1848 году и продолжалась до 1849 года.

Преобладающее мнение заключалось в том, что холера распространяется либо миазмами, либо при личном контакте. Сноу начал обследовать жертв и обнаружил, что их начальные симптомы всегда были связаны с желудочно-кишечным трактом. Сноу пришел к выводу, что, если холера распространяется через плохой воздух, она должна вызывать легочные симптомы, но, поскольку симптомы были желудочно-кишечными, возможно, она передалась через воду или потребление пищи.Фактически, холера вызывается бактерией Vibrio cholera, , которая передается фекально-оральным путем, то есть при приеме внутрь воды или пищи, загрязненной сточными водами.

В августе 1849 года Сноу опубликовал статью, озаглавленную « О способе передачи холеры », в которой он представил свою теорию о том, что болезнь передается при употреблении загрязненной воды, но его теория не получила большой поддержки в медицинском истеблишменте. Эпидемия закончилась в 1849 году, но Сноу продолжал собирать данные о характере заболевания и начал находить доказательства связи холеры с конкретными источниками воды.

Многие лондонцы получали воду из колодцев с ручными насосами (внизу), которые были расположены по всему городу.

Однако все большее число предприятий и домов получают воду из реки Темзы частными компаниями. Сноу узнал из муниципальных отчетов, что две частные компании поставляли воду по трубам в районы, которые в первую очередь пострадали от холеры. Некоторым потребителям поставляла компания Lambeth Company, а другим — Southwark & ​​Vauxhall.На карте Лондона ниже показаны районы Лондона, обслуживаемые этими двумя компаниями водоснабжения.

Southwark & ​​Vauxhall перекачивает воду из более низкого по течению участка, который был явно загрязнен, и уровень заболеваемости холерой у их клиентов был явно выше, чем у тех, которые поставляла компания Lambeth. Тем не менее, многих не убедили его выводы, поскольку Сноу на самом деле не продемонстрировал, что вода содержит что-то, что может вызвать холеру.

В конце августа 1853 года в районе Брод-стрит вспыхнула холера, жители запаниковали, и многие начали бежать.Ручной насос был обнаружен прямо на Брод-стрит, и Сноу сразу заподозрил. Пробы воды не показали серьезного загрязнения, но Сноу упорствовал и начал собирать подробную информацию о том, где жертвы берут питьевую воду. Он получил имена и адреса первых 83 жертв, которые умерли к концу первой недели. Он пошел к ним домой и узнал от родственников, что подавляющее большинство из них получали воду из насоса на Брод-стрит.

Сентябрь.6 Сноу появился на заседании местного Совета попечителей и представил свои доказательства того, что насос был источником вспышки. Он утверждал, что ручку насоса следует снять, чтобы предотвратить дальнейшее загрязнение. Правление не убедило, но согласилось снять ручку насоса в качестве меры предосторожности. Эпидемия быстро улеглась.

Расследование продолжается. В конечном итоге Сноу удалось найти 197 жертв, подавляющее большинство из которых жили в пешей доступности от насоса.Также было отмечено, что в соседнем рабочем доме, а также на пивоваренном заводе «Лайон» заболеваемость холерой была чрезвычайно низкой, и оба этих предприятия имели собственное водоснабжение. Рабочие другого крупного предприятия использовали воду из насоса на Брод-Стрит, и их рабочие серьезно заболели холерой.

На карте ниже показано расположение помпы, а дом или офис пострадавших обозначен стопками маленьких темных отметин, которые четко сгруппированы вокруг помпы. Этот тип карты, на которой отмечается местонахождение случаев заболевания, теперь называется «точечной картой».

Первоначальный осмотр скважины не выявил каких-либо проблем, что поставило под сомнение выводы Сноу, и насос был снова открыт без происшествий. Однако несколько месяцев спустя сотрудник Сноу наткнулся на записи о младенце, умершем от диареи в самом начале вспышки. Время ее смерти указывало на то, что она впервые заболела холерой. На допросе мать сказала, что вылила ведро с поносом младенца в выгребную яму перед их домом, непосредственно рядом с водяным насосом.Затем были выкопаны выгребная яма и насосный колодец, в результате чего выяснилось, что выгребная яма, которая находилась в трех футах от колодца, протекала, а стена колодца была разрушена, что позволило загрязнению из выгребной ямы просочиться внутрь. Оглядываясь назад, можно сказать, что это Оказалось, что после смерти ребенка заражение колодца прекратилось, и эпидемия прекратилась.

На этом графике показано количество смертей от холеры с течением времени. В самом конце августа наблюдается резкий рост смертности от холеры. Пик смертности приходится на 2 сентября, когда погибло около 130 человек, а уровень смертности от холеры постепенно снижается почти до нуля в течение следующих трех недель.

Зная инкубационный период болезни, форма эпидемической кривой иногда может дать ключ к разгадке источника эпидемии. Инкубационный период холеры составляет всего 1-3 дня, и этот график показывает, что новые случаи заболевания произошли в течение примерно 10 дней. Это предполагает эпидемию «постоянного источника» воздействия холеры, поскольку новые случаи заболевания продолжают возникать в течение более чем одного инкубационного периода, что указывает на постоянный источник заражения.

Оглядываясь назад, можно сказать, что Сноу внес несколько важных вкладов в развитие эпидемиологического мышления:

• Он предложил новую гипотезу о том, как передается холера.
• Он систематически проверял эту гипотезу, сравнивая группы людей.
• Он представил доказательства связи между выпивкой из колодца Брод-Стрит и заболеванием холерой.
• Он выступал за вмешательство, которое предотвратило другие случаи (снятие ручки насоса).

Отчет Эдвина Чедвика о санитарных условиях

С введением общей регистрации с июля 1837 года стало возможным собрать статистику смертности по всей Англии и Уэльсу. Эдвин Чедвик (1800-1890) использовал эту информацию, чтобы написать свой знаменитый отчет. Это способствовало принятию Закона об общественном здравоохранении (1848 г.) и созданию Совета по здравоохранению, в котором Чедвик служил комиссаром, пока он не был упразднена в 1854 году.Вот основные выводы:

«После столь тщательного изучения собранных доказательств, как я позволил себе сделать, позвольте мне резюмировать основные выводы, которые мне кажется, что это доказательство подтверждает.

Первые по объему и эксплуатации зла, являющегося предметом данного расследования: —

Что различные формы эпидемических, эндемических и других болезней вызвали, или усугубляется или распространяется главным образом среди рабочих классов за счет атмосферных примеси, образующиеся при разложении веществ животного и растительного происхождения влажными и грязь, и тесные и переполненные жилища преобладают среди населения в каждой части королевства, будь то жилище в отдельных домах, в сельской местности деревень, в маленьких городах, в больших городах — поскольку они были обнаружены преобладают в самых нижних районах мегаполиса.

Что такое заболевание, где бы ни были часты его приступы, всегда связано с с физическими обстоятельствами, указанными выше, и когда эти обстоятельства удаляются дренажем, правильным очищением, улучшенной вентиляцией и другими способами уменьшения загрязнения атмосферы, частоты и интенсивности таких заболеваний утихает; и где удаление вредных агентов кажется полным, такое заболевание почти полностью исчезает.

Это высокое процветание в отношении занятости и заработной платы, а также разнообразие и изобилие пищи, не предоставили рабочим классам никаких исключений от нападений эпидемические заболевания, которые были столь же частыми и столь же смертельными в периоды коммерческих и процветание производства, как и в любом другом.

Что формированию всех привычек чистоты препятствуют дефектные запасы воды.

Что ежегодные потери людей из-за грязи и плохой вентиляции превышают потери от смерти или ран в любых войнах, в которых участвовала страна в современности.

То из 43 000 случаев вдовства и 112 000 случаев обездоленного сиротского приюта избавившись от низких ставок только в Англии и Уэльсе, кажется, что наибольшая доля смертей глав семей произошла от вышеперечисленных указанные и другие устранимые причины; что их возраст был меньше 45 лет; то есть на 13 лет ниже естественной вероятности жизни, как показано по опыту всего населения Швеции.

Общественный ущерб от преждевременной смерти глав семей составляет больше, чем может быть представлено любым перечислением материального бремени вследствие их болезни и смерти.

То, что, измеряя потерю трудоспособности среди больших классов по экземплярам выгоды, даже от неполных мер по устранению вредных влияний с места работы или с места жительства, что эта потеря не может быть меньше восьми или десять лет.

Что разрушительные последствия эпидемий и других болезней не уменьшаются, а уменьшают для увеличения давления населения.

Что в районах с наибольшей смертностью рождаются не только достаточно, чтобы заменить числа, удаленные смертью, но добавить к населению.

Что молодое население, выращенное под воздействием вредных физических сил, хуже в физической организации и общем здоровье для населения, сохраненного от наличие таких агентств.Что население, подвергшееся такому воздействию, менее восприимчиво моральных влияний, а эффекты образования более преходящи, чем со здоровым населением.

Что эти неблагоприятные обстоятельства, как правило, приводят к тому, что взрослое население недолговечно, непредусмотрительный, безрассудный и несдержанный, с привычной жадностью к чувственным вознаграждения.

Что эти привычки приводят к отказу от всех удобств и приличий жизни, и особенно приводят к перенаселенности их домов, что является разрушительны для нравственности, а также для здоровья больших классов обоих полов.

Эта неполноценная городская очистка порождает привычки к самой низменной деградации. и ведет к деморализации большого числа людей, живущих с помощью того, что они находят среди ядовитой грязи, накопленной в заброшенных улицы и закутки.

Что расходы на местные общественные работы в целом неравны и несправедливы оцениваются, жестко и неэкономно собираются отдельными коллекциями, расточительно расходуется на отдельные и неэффективные операции неквалифицированными и практически безответственные офицеры.

Что действующий закон об охране здоровья и конституционный механизмы для восстановления его исполнения, такие как Courts Leet, упали в отчаянии, и находятся в состоянии, обозначенном преобладанием зла они были предназначены для предотвращения.

Во-вторых . Что касается средств, с помощью которых текущее санитарное состояние рабочих классов может быть улучшено: —

Основные и наиболее важные меры, и в то же время наиболее целесообразные, и в пределах признанной области государственного управления являются дренажем, вывоз всего мусора из домов, улиц и дорог и благоустройство запасов воды.Что главные препятствия к немедленному удалению разлагающегося мусора городов и жилых домов были расходами и досадой ручного труда и гужевого транспорта, необходимого для этой цели.

Эти расходы могут быть уменьшены до одной двадцатой или до одной тридцатой, или становится незначительным, с использованием воды и самодействующих средств удаления улучшенными и более дешевыми канализационными коллекторами и стоками.

Такие отходы, когда они находятся во взвешенном состоянии в воде, могут быть наиболее дешевыми и дешевыми. безобидно доставлен на любое расстояние за город, а также в лучшем виде для производительного использования, и что потери и травмы из-за загрязнения естественных потоков можно избежать.

Что для всех этих целей, а также для бытового использования лучше расходные материалы воды абсолютно необходимы.

То для успешного и экономичного осушения заимствования геологических участков как основа операций.

Что соответствующие научные меры для общественного дренажа позволят важные объекты для частных земель — дренаж, что важно для здоровье, а также пропитание трудящихся классов.

Что за счет коммунальной канализации, водоснабжения в домах, и средств улучшенного очищения было бы материальной выгодой за счет уменьшения существующие обвинения по болезни и преждевременной смертности.

Для защиты трудящихся и налогоплательщиков от неэффективность и расточительство во всех новых конструктивных решениях для защиты общественного здравоохранения, и обеспечить уверенность населения в том, что расходы будет выгодным, необходимо принять меры, чтобы все новые местные общественные работы разрабатываются и проводятся ответственными сотрудниками, обладающими квалификацией науки и навыков инженеров-строителей.

Что жестокость и несправедливость сборов для всех немедленных затрат по таким работам лица, имеющие лишь краткосрочный интерес к выгоде, могут следует избегать, осторожно распределяя расходы на периоды, совпадающие с преимущества.

То, что согласно соответствующим договоренностям, 10 или 15 процентов от обычных затрат на дренаж можно сэкономить, что при оценке затрат на необходимые структурные изменения только одной трети существующих многоквартирных домов будут экономия в полтора миллиона фунтов стерлингов, помимо сокращения будущие расходы управления.

Для профилактики заболеваний, вызванных дефектами вентиляции. и другие причины загрязнения на рабочих местах и ​​в других местах, где номера собраны, а для всеобщего раскрутки средства необходимы чтобы предотвратить болезнь, было бы неплохо назначить участкового врачебного должностное лицо, независимое от частной практики, и с ценными бумагами специального квалификация и ответственность за принятие санитарных мер и восстановление исполнение закона.

Что при сочетании всех этих договоренностей, вероятно, что полный продолжительный период жизни, указанный в шведских таблицах; то есть увеличение не менее 13 лет, может быть распространено на всех работающих классы.

Чтобы достижение этих и других побочных преимуществ сокращения существующие сборы и расходы находятся в компетенции законодательного органа, и зависят в основном от ценных бумаг, взятых для практического применения. наука, навыки и экономика в направлении местных общественных работ.

И что устранение вредных физических обстоятельств и продвижение по службе гражданской, бытовой и личной чистоты, необходимы для улучшения морального состояния населения; для этой здоровой морали и утонченности в манерах и здоровье не долго совмещаются с грязными привычками среди любой класс сообщества ».

[Полный текст] Устойчивость к антибиотикам при нетифоидной сальмонеллезной инфекции

Введение

В Китае безопасность пищевых продуктов была признана вторым по величине риском заболеваний. ¹ 70–80% случаев пищевых отравлений были вызваны Salmonella в Китае. ² Несмотря на то, что санитарные меры, стандарты очистки воды и безопасности пищевых продуктов улучшились за последние десять лет, инфекции, вызываемые НТС у детей, остаются проблемой глобального общественного здравоохранения. ³ По оценкам ВОЗ, 93,8 миллиона случаев гастроэнтерита во всем мире связаны с инфекциями Salmonella каждый год и инфекциями Salmonella стали причиной 155 000 смертей. ⁴ В США NTS вызывает 1.2 миллиона болезней, 23 000 госпитализаций и 450 смертей соответственно. ⁵ В Китае в течение 2000–2009 гг. НТС ежегодно вызывала 9,87 миллиона случаев гастроэнтерита и 792 случая смерти. ⁶ Ввиду серьезности ситуации в последние годы в Китае был усилен лабораторный надзор за инфекциями, вызываемыми НТС. ⁷

Salmonellae — группа грамотрицательных факультативных анаэробных бактерий. Род Salmonella , названный в честь Dr.Дэниел Сэлмон был впервые описан в 1866 году доктором Теобальдом Смитом. ⁸ Существует три типа поверхностных антигенов Salmonella : антигены тела (O), антигены жгутиков (H) и капсульные антигены (VI). По антигенам «О» можно классифицировать различные серогруппы Salmonella . И в соответствии с антигенами «H» можно дополнительно разделить разные серотипы. Salmonella включает более 2600 серотипов, относящихся к 42 серогруппам. ^9,10 И Salmonella можно разделить на Salmonella typhi и NTS. Salmonella typhi подразделяются на тифоидную палочку и паратифосную палочку, которые могут вызывать брюшной тиф и паратиф. Другие серотипы, известные как NTS, могут вызывать острый гастроэнтерит, хронический энтерит, сепсис и другие заболевания. Предыдущие исследования показали, что дети младшего возраста являются наиболее уязвимой группой для НТС. ^11,12 Незрелый иммунитет может быть причиной высокого риска инфицирования на этой стадии. ¹³ Национальное исследование показало, что в 2008 году в Китае 34% больных диареей, инфицированных NTS, были в возрасте <5 лет. ⁷ Патогенность Salmonella в основном связана с факторами вирулентности, которые он несет, включая Salmonella островов патогенности (SPI), плазмиды вирулентности, пили и энтеротоксины. ¹⁴ Патогенные факторы NTS будут высвобождаться, чтобы побудить хозяина развить воспалительную реакцию слизистой оболочки после инфекций NTS. ¹⁵ Когда хозяин пытается уничтожить бактерии, это может вызвать «побочный ущерб», который нарушает микроэкологический баланс кишечника человека, что приводит к клиническим симптомам, таким как диарея. ¹³ NTS гастроэнтерит в большинстве случаев является самоизлечивающимся заболеванием и проходит у здоровых детей в течение одной недели. ¹⁶ Однако часть случаев может привести к инвазивным заболеваниям человека, включая системные инфекции, такие как бактериемия, васкулит, внутричерепные инфекции, респираторные инфекции, инфекции мочевыводящих путей и остеомиелит. Инвазивные NTS-инфекции могут быть опасными для жизни и обычно возникают у младенцев, пожилых людей и пациентов с иммунодефицитом. ¹⁷ И терапия антибиотиками показана только в том случае, если она вызывает тяжелые инфекции или инвазивную инфекцию. ^18,19 Схемы антибиотиков, рекомендованные клиницистами против инфекций человека Salmonella , включают цефалоспорины третьего поколения, хинолоны и макролиды. ²⁰ Учитывая побочные эффекты препарата, детям рекомендуется применять цефалоспорины третьего поколения. Неправильное использование антибиотиков — важный фактор, обуславливающий высокую устойчивость к антибиотикам. И устойчивость к антибиотикам особенно проблематична при этих системных инфекциях, когда лечение антибиотиками может спасти жизнь. ²¹ Штаммы бактерий, устойчивые к трем или более чем трем классам противомикробных препаратов, определяются как штаммы с множественной лекарственной устойчивостью (МЛУ). Сообщалось, что около 17–20% штаммов обладают устойчивостью к антибиотикам, а заболеваемость МЛУ за рубежом растет. ^22,23 Исследование, проведенное в Шанхае, Китай, показало, что чувствительность к противомикробным препаратам показывает, что 60,5% изолятов устойчивы к одному из клинически важных антибиотиков. ²⁴ Другое исследование в Шанхае показало, что только 1,1% штаммов были чувствительны ко всем 16 антибиотикам, а уровни устойчивости к антибиотикам цефалоспоринов третьего и четвертого поколения (цефотаксим и цефепим) составляли 10% и 8.1%. ²⁵ Кроме того, исследование в Гуанчжоу показало, что годовые показатели устойчивости ампициллина относительно стабильны, в то время как уровни устойчивости NTS к цефтазидиму в 2015 году (31,43%) были значительно выше, чем в 2014 году (16%). И уровни устойчивости к антибиотикам к ампициллину между изолятами серотипа Typhimurium и Enteritidis были значительно выше, чем у других серотипов. ²⁶ Показатели лекарственной устойчивости Salmonella к цефалоспорину и цефепиму составляли 22.3% и 13,1%, соответственно, в 4 больницах в Шэньчжэне, ²⁷ , что было выше, чем результаты предыдущих исследований в Китае. ^28,29 Это явление показывает, что устойчивость к антибиотикам не оптимистична. Что касается механизмов устойчивости к антибиотикам, это предполагает, что соответствующие гены устойчивости обычно располагаются либо в плазмидах, транспозонах, генных кассетах, либо в вариантах геномных островков SGI1 и SGI2 Salmonella . ³⁰ Однако исследования инфекций NTS и изменения устойчивости к антибиотикам в педиатрии ограничены в Китае.Мы стремились обобщить клинические особенности, серотип, серогруппу и изменения устойчивости к антибиотикам в период с 2009 по 2018 год в Чунцине, Юго-Западный Китай. Чтобы повысить степень осознания болезни, соответственно улучшить возможности диагностики и лечения в клинической практике.

Материалы и методы

Дизайн исследования и сбор данных

Это ретроспективное исследование, проведенное в период с января 2009 года по декабрь 2018 года в детской больнице Чунцинского медицинского университета, одной из крупнейших детских больниц Китая.Ежегодные амбулаторные посещения нашей больницы составляют около 3 миллионов, а ежегодные стационарные посещения — около 80 000. В этом исследовании были собраны клинические данные детей с положительной культурой NTS. Другие клинические данные, такие как возраст, пол, продолжительность госпитализации и результаты теста на чувствительность к антибиотикам NTS, были ретроспективно проанализированы для пациентов младше 18 лет (удаление новорожденных).

Сбор образцов, бактериальные культуры и тест на чувствительность к лекарствам

Мы собрали разные образцы в соответствии с клиническими симптомами и оценкой клинициста.В наше исследование были включены образцы кала, крови, костного мозга, спинномозговой жидкости и секретов. Образцы фекалий собирали в сухие, чистые, герметичные контейнеры для сбора образцов. Образцы крови и костного мозга сразу после забора помещали в специальный сосуд для гемокультуры. Образцы спинномозговой жидкости были собраны и помещены в стерильные пробирки для бактериального посева. Экскременты собирали с помощью стерильной пробирки для мазка из глотки. Хромогенный агар Salmonella был использован для быстрого выделения и идентификации Salmonella (Shanghai Comagal Microbial Technology CO., ООО). Для увеличения скорости культивирования бактерий образцы и предпролиферативная культуральная среда помещали в инкубатор с постоянной температурой 36 ° C ± 1 ° C на 4-6 часов для обогащения. Препролиферативный раствор инокулировали в культуральную среду с селенитом цистином для вторичной пролиферации в течение 18–24 часов. Затем раствор для пролиферации высевали на чашку с агаром на 18–24 часа. Если не было типичных или подозрительных колоний, мы обычно продолжаем культивирование в течение еще 24 часов. Серотипирование, серогруппирование и тест на чувствительность к антибиотикам были дополнительно проведены для пациентов с положительной культурой NTS.Мы исключаем образцы одного и того же типа от одного и того же пациента в случае повторения. Тесты на чувствительность к антибиотикам оценивали диско-диффузионным методом Кирби-Бауэра (Oxoid, UK). Изоляты были классифицированы как резистентные, промежуточные и чувствительные в соответствии с рекомендациями Института клинических лабораторных стандартов (CLSI). ³¹ Escherichia coli ATCC25922 использовали для контроля качества в тесте диффузии диска.

Статистический анализ

Статистический анализ проводился с использованием SPSS 19.0 редактор данных. Данные подсчета описывались с использованием частот и их пропорций, а для сравнения использовался критерий хи-квадрат (χ2). Данные измерений были описаны с использованием медианы, среднего ± стандартное отклонение и квартиля, по сравнению с использованием непараметрического критерия Манна-Уитни. Для всех анализов мы рассматривали статистическую значимость как p <0,05.

Результаты

Распространенность и клинические характеристики

За последние десять лет был подтвержден 501 случай инфекции NTS, из которых 459 были положительными только при посеве кала, 21 — только при посеве крови, 2 были положительными только при посеве гноя и 1 был положительным только при посеве костного мозга.Культура кала и крови была положительной в 14 случаях. Культура крови и костного мозга была положительной в 2 случаях. Культура крови и спинномозговой жидкости была положительной в 2 случаях. Хотя случаи заражения НТС имели место круглый год, пик приходился на период с лета по осень, в основном в июле (13,4%), августе (16,7%), сентябре (17,0%) и октябре (17,4%) (Рисунок 1). Среди этих 501 пациента, инфицированного NTS, 306 случаев были мужчинами и 195 женщинами, при соотношении мужчин и женщин 1,5: 1. Основной возраст начала заболевания — от одного месяца до трех лет (84.8%), из которых 44,9% были моложе 1 года. Среди этих 501 пациента у 84,2% была лихорадка, которая в основном была умеренной или высокой. Средняя температура составляла 39,5 ° C (диапазон 37,6–42 ° C, среднее значение 39,5 ± 0,04 ° C), а средняя продолжительность термического периода составляла 3 дня (диапазон 1–41 день, среднее значение 4,47 ± 0,20 дня). 472 пациента (94,2%) страдали диареей. Их стул был в основном водянистым или липким. Среди детей с диареей фекалии содержали слизь только в 218 случаях (46,2%), только кровь в 31 случае (6,6%), слизь и кровь — в 18 случаях (3.8%). И 25 случаев (5,3%) показали типичный слизисто-гнойный кровянистый стул. У остальных (38,1%) слизь и кровь в стуле отсутствовали. Средняя частота диареи составляла 7 раз в день (от 2 до 30 раз в день, в среднем 7,67 ± 0,18 раз в день). Средняя продолжительность диареи составляла 10 дней (от 1 до 240 дней, в среднем 12,0 ± 0,59 дня). Другими сопутствующими симптомами были рвота, судороги, боль в животе и вздутие живота. Лабораторные тесты показали, что на долю ПКТ, СРБ и повышения лейкоцитов приходилось 94.6%, 57,1% и 37,3% соответственно.

Серогруппа и серотип

Серогруппа B (67,5%) была преобладающими изолятами серогруппы, за ней следовали серогруппы C (11,8%), D (11,6%), E (4,2%), разгруппированные (5%) и один случай был группой поливалентной сыворотки. Идентификация серотипа была проведена на 284 изолятах.Всего среди изолятов идентифицировано 12 серотипов. Salmonella Typhimurium был наиболее распространенным серотипом, составляя 79,2% (225/284), за ним следовал Salmonella, Enteritidis (9,5%, 27/284). Другие редкие серотипы Salmonella включали Salmonella Derby, Stanley, Dublin, London, Aragorn, Newport, Bovis morbifificans, Sao Paulo, Weltevreden, Anatum, и один случай был поливалентным серотипом (Таблица 1).

Тесты на чувствительность к антибиотикам

В нашем исследовании большинство пациентов (95.6%) получали антибактериальную терапию. И у большинства пациентов (92,42%) из клиники было разрешено лечение с помощью соответствующей терапии. Результаты чувствительности к антибиотикам показали, что самые высокие показатели устойчивости к антибиотикам были зарегистрированы в отношении цефазолина и аминогликозидных антибиотиков (амикацин, гентамицин, тобрамицин), 93,8%, 94,1%, 98,2%, 95,1% соответственно, за которыми следует ампициллин (82,7%), хлорамфеникол (59,3%), котримоксазол (44,2%), ципрофлоксацин (18,5%), левофлоксацин (7,2%). Среди цефалоспоринов третьего поколения показатели устойчивости к антибиотикам цефотаксима, цефтриаксона цефтазидима были (33.3%), (32,5%), (18,7%) соответственно. Уровень устойчивости цефепима к антибиотикам составил 20,8%. Уровень устойчивости пиперациллин-тазобактама к антибиотикам составлял около 7,1%, а уровень устойчивости к имипенему — менее 1% (таблица 2). Тесты на чувствительность к антибиотикам показали, что у NTS были самые высокие показатели устойчивости к аминогликозидным антибиотикам, высокие показатели устойчивости к ампициллину и цефазолину и относительно низкие показатели устойчивости к амоксициллин-клавуланату калия, пиперациллин-тазобактаму и цефтазидиму. Показатели устойчивости к хинолоновым антибиотикам (ципрофлоксацин, левофлоксацин) были ниже 20%, среди которых левофлоксацин был самым низким (менее 10%).

Изменения лекарственной устойчивости за последнее десятилетие

В нашем исследовании сравнивали уровни устойчивости к антибиотикам у NTS в период с 2009 по 2013 год и с 2014 по 2018 год (Рисунок 2). Мы обнаружили, что показатели устойчивости НТС к антибиотикам к цефазолину (с 77,1% до 95,9%), цефотаксиму (с 28,3% до 34,4%), ципрофлоксацину (с 12,0%).От 3% до 19,2%) и левофлоксацина (с 1,9% до 7,9%). Показатели устойчивости к антибиотикам к хлорамфениколу (с 66,7% до 56,9%), ампициллину (с 56,1% до 42,8%), цефтриаксону (с 44,2% до 32,1%), цефепиму (с 27,3% до 20,1%) и сложному сульфаметоксазолу (с 89,6%). % до 81,7%) показали тенденцию к снижению. Показатели устойчивости НТС к антибиотикам к пиперациллин-тазобактаму (с 21,4% до 5,4%) и цефтазидиму (с 30,6% до 17,1%) значительно снизились. Но общий уровень устойчивости к антибиотикам оставался высоким.

Изоляты MDR

К концу 1980-х годов несколько стран сообщили о штаммах Salmonella с множественной лекарственной устойчивостью.В нашем исследовании 69 штаммов (13,8%) МЛУ были выделены от 501 ребенка с инфекциями НТС. Доля изолятов МЛУ имеет тенденцию к снижению (рис. 3).

Распространенность и устойчивость к антибиотикам

Salmonella Typhimurium был наиболее распространенным серотипом среди инфекций NTS.Мы обнаружили, что распространенность Salmonella Typhimurium была выше в последние годы. Salmonella Инфекции Typhimurium составили 79,2% от общего числа инфекций NTS в нашей больнице (Рисунок 4). Частота устойчивости к антибиотикам у Salmonella Typhimurium представлена ​​в таблице 3. Наше исследование обнаружило, что тенденция изменений устойчивости к антибиотикам у Salmonella Typhimurium в основном соответствовала тенденции общей устойчивости к антибиотикам NTS.

Обсуждение

В Китае NTS является основным кишечным патогеном острого гастроэнтерита у детей. ^7,24 За последние десять лет 501 пациент был выявлен с инфекциями НТС. Основными симптомами при поступлении были лихорадка, диарея и слизистый стул, реже — рвота и кровянистый стул. В нашем исследовании большинство случаев произошло у младенцев, что согласуется с ретроспективным исследованием, проведенным в специализированной детской больнице в Гуанчжоу. ²⁶ Сообщалось, что инфекции NTS обычно вызываются коммерчески производимой пищей, загрязненной фекалиями животных. ³² NTS, как один из наиболее распространенных зоонозных патогенов, ³³ можно отнести к таким животным, как несушки, свиньи, крупный рогатый скот, рептилии и бройлеры. ³⁴ На этом этапе младенцы с большей вероятностью будут подвергаться воздействию загрязненной окружающей среды, потому что это время, когда они учатся лазать, ходить и бегать. Таким образом, необходимы усиленные программы контроля NTS в резервуарах для животных, особенно в птицеводстве, а также более эффективные методы гигиены на всей цепочке производства пищевых продуктов.Кроме того, во всем мире зарегистрированы вспышки Salmonella , связанные с продуктами из детского молока. ^35–38 Было подтверждено, что грудное вскармливание может снизить риск спорадического сальмонеллеза среди младенцев, поскольку исключительно грудное вскармливание может помочь младенцам избежать контакта с зараженной пищей. Кроме того, некоторые исследования показали, что некоторые компоненты грудного молока могут препятствовать адгезии и инвазивности Salmonella к клеткам кишечника человека. ^39,40 Итак, рекомендуем грудное вскармливание в младенчестве. Хотя инфицирование NTS происходило в течение года, самые высокие показатели заболеваемости приходились на период от летнего до осеннего (с июля по октябрь), что совпадает с жаркой и дождливой погодой в Чунцине. Исследование, проведенное в Казахстане и Центральной Азии, показало, что повышение температуры на 1 ° C было связано с увеличением числа случаев заболевания на 5,5%, а увеличение количества осадков на 1 мм было связано с увеличением числа случаев сальмонеллеза на 0,6% в те же месяцы. ⁴¹ Сильные дожди приводят к загрязнению питьевой воды и окружающей среды, что может быть правдоподобным объяснением положительной связи. Наши результаты соответствовали исследованию из Шанхая и Чжэцзяна. ^24,42

Среди этих 501 пациента, инфицированного NTS, серогруппа B была наиболее распространенными изолятами серогруппы. Исследование, проведенное на Тайване в период с 2000 по 2009 год, также показало, что серогруппа B была преобладающей серогруппой. ⁴³ Всего среди 284 изолятов идентифицировано 12 серотипов. Salmonella Typhimurium был преобладающим серотипом (79,2%), за ним следовал Salmonella Enteritidis (9,5%). Другие исследования в Китае также показали, что Salmonella Typhimurium был наиболее распространенным серотипом. ^14,26,44,45 И Salmonella Typhimurium также был наиболее распространенным серотипом в Северной Америке и Океании. ⁴⁶ Однако некоторые другие исследования показали, что Salmonella Enteritidis был наиболее распространенным серотипом в Китае. ^17,24,47 В Японии Salmonella Ser. infantis был наиболее часто обнаруживаемым серотипом Salmonella в морепродуктах. ⁴⁶ В США преобладающими изолятами был серотип Дублин. ²³ Одним словом, распространение сальмонелл имеет ярко выраженные региональные особенности, а распространенность серотипов различна в разных регионах.

В последние годы уровень выявления инфекций NTS у стационарных пациентов значительно увеличился, что связано с ростом птицеводства, улучшением транспорта и повышением зрелости методов обнаружения.С 2015 года хромогенный агар Salmonella используется для быстрого выделения и идентификации Salmonella , что значительно повысило уровень обнаружения Salmonella . Повышенный уровень выявления NTS также указывает на то, что инфекции NTS у детей остаются серьезной проблемой для общественного здравоохранения. Не рекомендуется лечение антибиотиками при общем гастроэнтерите, возникшем в результате инфекций НТС, у здоровых детей. ¹⁶ Потому что, как сообщается, лечение антибиотиками увеличивает продолжительность выведения бактерий из кишечного тракта. ⁴⁸ Однако большинство пациентов (95,6%) получали антибиотики в нашем исследовании, что может быть связано с региональными и популяционными различиями. Будучи центром детской больницы третьего уровня на юго-западе Китая, наша больница приняла много пациентов из близлежащих районов. Большинство из них все еще имели симптомы на момент поступления, хотя лечились в других больницах. Тем не менее, использование антибиотика было намного выше, чем мы ожидали. Сгруппировав и сравнив уровни устойчивости к антибиотикам за последние десять лет, мы обнаружили, что уровни лекарственной устойчивости хинолонов в целом были относительно низкими, что может быть связано с относительно более низким коэффициентом использования хинолонов у детей, учитывая побочные эффекты у детей. .Цефалоспорины третьего поколения были первым рекомендованным препаратом для детей. Уровень его устойчивости составлял от 17,1% до 34,4%, что было выше, чем во всех предыдущих исследованиях в Китае. ^25,27 Цефалоспорины расширенного спектра действия, особенно цефтриаксон, ранее предлагались в качестве препаратов первой линии для лечения детей с серьезными нетифоидными инфекциями Salmonella . Однако показатели лекарственной устойчивости цефтриаксона оставались на высоком уровне в течение последних десяти лет, что было значительно выше, чем у Гуандун ¹² и Ханчжоу ¹⁴ в Китае.Таким образом, лекарственная устойчивость цефтриаксона на юго-западе Китая вызывает тревогу. Но показатели устойчивости НТС к антибиотикам к пиперациллин-тазобактаму (с 21,4% до 5,4%) и цефтазидиму (с 30,6% до 17,1%) значительно снизились. Возможно, цефтазидим — лучший выбор, учитывая более высокую лекарственную устойчивость цефтриаксона. В нашем исследовании 69 штаммов МЛУ (13,8%) были выделены от 501 ребенка с инфекциями НТС. Доля изолятов МЛУ имеет тенденцию к снижению, что может быть связано с ограничением использования антибиотиков у животных.Устойчивость к антибиотикам в NTS в значительной степени возникает из-за использования антибиотиков в животноводстве. ²¹ В последние годы в целях обеспечения качества и безопасности продуктов животного происхождения и здоровья населения были введены некоторые ограничения на использование антибиотиков. ⁴⁹ Хотя карбапенем как особый класс антибиотиков, уровень его резистентности составлял менее 1%, в последние годы резистентность к лекарствам все же увеличивалась. И мы обнаружили три устойчивых к имипенему штамма в течение 2014–2018 гг.Однако мы не обнаружили, что штамм был устойчив к карбапенемным антибиотикам в 2009–2013 гг. Это явление указывает на серьезность ситуации с устойчивостью к антибиотикам. Примечательно, что в будущем эта тенденция может усилиться. Поэтому в клинической практике следует избегать злоупотребления антибиотиками. Высокие показатели лекарственной устойчивости к цефалоспоринам третьего поколения и растущая устойчивость к хинолонам среди детей с инфекциями NTS в Чунцине являются серьезной проблемой общественного здравоохранения, которая требует постоянного мониторинга и рационального использования антибиотиков.

Заключение

В заключение, большинство пациентов с инфекциями NTS были моложе трех лет, в основном с июля по октябрь. Мы должны уделять больше внимания безопасности пищевых продуктов для детей и не допускать их употребления в пищу продуктами, загрязненными НТС, особенно летом и осенью. Salmonella Typhimurium был наиболее распространенным серотипом. Показатели устойчивости NTS к антибиотикам к пиперациллин-тазобактаму, цефтриаксону, цефтазидиму и цефепиму показали тенденцию к снижению за последние десять лет, среди которых значительно снизились показатели пиперациллин-тазобактама и цефтазидима.Так, в Юго-Западном Китае цефтазидим рекомендуется при тяжелых или инвазивных инфекциях, вызванных инфекциями NTS, до тех пор, пока не будут получены результаты теста на чувствительность к лекарствам. Однако в целом показатели устойчивости к антибиотикам были на высоком уровне. Из 501 изолята выявлено 69 штаммов МЛУ (13,8%). Поэтому в нашей стране важны постоянный надзор за лекарственной устойчивостью при НТС и меры контроля, такие как предотвращение ненужной антибактериальной терапии при общем гастроэнтерите НТС.

Этическое разрешение

Это исследование было одобрено этическим комитетом детской больницы Чунцинского медицинского университета.Все данные были обезличены для сохранения конфиденциальности пациентов, а исследование проводилось в соответствии с Хельсинкской декларацией. В свете ретроспективного и анонимного характера исследования Этический комитет не требовал письменного информированного согласия пациентов.

Благодарность

Ли-цзюань Ву, Янь Луо, Го-лу Ши следует считать соавторами.

Финансирование

Нет источников финансирования.

Раскрытие

Авторы не сообщают о конфликте интересов.

Список литературы

1. Паудьял Н., Пан Х., Ляо X и др. Мета-анализ основных патогенов пищевого происхождения в китайских пищевых продуктах в период с 2006 по 2016 год. Foodborne Pathog Dis . 2018; 15 (4): 187–197. DOI: 10.1089 / fpd.2017.2417

2. Скаллан Э., Хукстра Р.М., Ангуло Ф.Дж. и др. Болезни пищевого происхождения, приобретенные в США — основные возбудители. Emerg Infect Dis . 2011; 17 (1): 7–15. DOI: 10.3201 / eid1701.p11101

3. Магведере К., Рауф Д., Де Клерк Г., Кедди К. Х., Дзива Ф.Заболеваемость нетифоидной сальмонеллой у сельскохозяйственных животных, кормов для животных и связанной с ними окружающей среды в Южной Африке, 2012–2014 гг. Clin Infect Dis . 2015; 61 (Приложение 4): S283 – S289. DOI: 10.1093 / cid / civ663

4. Majowicz SE, Musto J, Scallan E, et al. Глобальное бремя нетифоидного сальмонеллезного гастроэнтерита. Clin Infect Dis . 2010. 50 (6): 882–889. DOI: 10.1086 / 650733

5. Medalla F, Gu W, Mahon BE, et al. Расчетная частота нетифоидных инфекций сальмонелл, устойчивых к противомикробным препаратам, США, 2004–2012 гг. Emerg Infect Dis . 2016; 23 (1): 29–37. DOI: 10.3201 / eid2301.160771

6. Мао X, Ху JF, Лю XM. Оценка бремени болезней пищевого нетифоидного сальмонеллеза в Китае с использованием метода обзора литературы. Профилактика контроля над подбородком . 2011. 15 (7): 622–625.

7. Ран Л., Ву С., Гао И и др. Лабораторный надзор за нетифоидной сальмонеллезной инфекцией в Китае. Дис. Патогенов пищевого происхождения . 2011; 8 (8): 921–927. DOI: 10.1089 / fpd.2010.0827

8.Шульц М. Теобальд Смит. Emerg Infect Dis . 2008; 14 (12): 1940–1942. DOI: 10.3201 / eid1412.081188

9. Десаи П. Т., Порволлик С., Лонг Ф. и др. Эволюционная геномика подвидов Salmonella enterica. МБИО . 2013; 4 (2). DOI: 10.1128 / mBio.00579-12

10. Марзель А., Десаи П. Т., Горен А. и др. Стойкие инфекции человека нетифоидной сальмонеллой: эпидемиология и генетика. Clin Infect Dis . 2016; 62 (7): 879–886. DOI: 10.1093 / cid / civ1221

11.Ван П., Гоггинс В. Б., Чан Э. Связь госпитализаций сальмонеллы с температурой окружающей среды, влажностью и осадками в Гонконге. Окружающая среда Инт . 2018; 120: (223–230. Doi: 10.1016 / j.envint.2018.08.014

12. Liang Z, Ke B, Deng X, et al. Серотипы, сезонные тенденции и устойчивость к антибиотикам нетифоидной сальмонеллы от пациентов-людей в провинции Гуандун, Китай, 2009–2012 гг. BMC Infect Dis . 2015; 15: (53. DOI: 10.1186 / s12879-015-0784-4

13. Fan Q, Yi M, Liu H, et al.Влияние возраста и типа патогенов на микробиоту кишечника у младенцев с диареей в Даляне, Китай. Может ли заразить Dis Med Microbiol . 2020; 2020: (8837156. Doi: 10.1155 / 2020/8837156

14. Юэ М., Ли X, Лю Д., Ху X. Серотипы, устойчивость к антибиотикам и гены вирулентности сальмонеллы у детей с диареей. J Clin Lab Анальный . 2020; 34 (12): e23525. DOI: 10.1002 / jcla.23525

15. Fritsch J, Abreu MT. Микробиота и иммунный ответ: что такое курица и что такое яйцо? Gastrointest Endosc Clin N Am .2019; 29 (3): 381–393. DOI: 10.1016 / j.giec.2019.02.005

16. Bula-Rudas FJ, Rathore MH, Maraqa NF. Сальмонеллезные инфекции в детстве. Адв Педиатр . 2015; 62 (1): 29–58. DOI: 10.1016 / j.yapd.2015.04.005

17. Катийо С., Мюллер-Пебоди Б., Минаджи М. и др. Эпидемиология и исходы нетифоидной сальмонеллезной бактериемии в Англии, 2004–2015 гг. J Clin Microbiol . 2019; 57 (1). DOI: 10.1128 / JCM.01189-18

18. Wen SC, Best E, Nourse C. Нетифоидные сальмонеллезные инфекции у детей: обзор литературы и рекомендации по ведению. J Детский педиатр . 2017; 53 (10): 936–941. DOI: 10.1111 / jpc.13585

19. Onwuezobe IA, Oshun PO, Odigwe CC. Противомикробные препараты для лечения симптоматической нетифоидной сальмонеллезной инфекции. Кокрановская база данных Syst Rev . 2012; 11: CD001167. DOI: 10.1002 / 14651858.CD001167.pub2

20. Ван X, Бисвас С., Паудьял Н. и др. Устойчивость к антибиотикам изолятов сальмонеллы тифимуриума, извлеченных из пищевой цепи в рамках национальной системы мониторинга устойчивости к противомикробным препаратам, в период с 1996 по 2016 год. Передний микробиол . 2019; 10: (985. Doi: 10.3389 / fmicb.2019.00985

21. Макдермотт П.Ф., Чжао С., Тейт Х. Устойчивость к противомикробным препаратам у нетифоидных сальмонелл. Микробиол Спектр . 2018; 6 (4). DOI: 10.1128 / microbiolspec.ARBA-0014-2017

22. Уильямсон Д.А., Лейн С.Р., Истон М. и др. Повышение устойчивости к противомикробным препаратам у изолятов нетифоидной сальмонеллы в Австралии с 1979 по 2015 гг. Антимикробные агенты Ch . 2018; 62 (2). DOI: 10.1128 / AAC.02012-17

23.Анджело К.М., Рейнольдс Дж., Карп Б.Е., Хекстра Р.М., Шил С.М., Фридман С. Устойчивость к противомикробным препаратам среди нетифоидных сальмонелл, выделенных из крови в США, 2003–2013 гг. J Заражение вирусом . 2016; 214 (10): 1565–1570. DOI: 10.1093 / infdis / jiw415

24. Li Y, Xie X, Xu X, et al. Нетифоидная сальмонеллезная инфекция у детей с острым гастроэнтеритом: распространенность, серотипы и устойчивость к противомикробным препаратам в Шанхае, Китай. Дис. Патогенов пищевого происхождения . 2014. 11 (3): 200–206. DOI: 10.1089 / fpd.2013.1629

25. Wei ZQ, Chang HL, Li YF, Xu XB, Zeng M. Клиническая эпидемиология и устойчивость к противомикробным препаратам нетифоидных кишечных инфекций сальмонеллы у детей: 2012–2014 гг. Чин Дж. Педиатр . 2016; 54 (7): 489–495. DOI: 10.3760 / cma.j.issn.0578-1310.2016.07.003

26. Liang B, Xie Y, He S, et al. Распространенность, серотипы и лекарственная устойчивость нетифоидной сальмонеллы среди педиатрических пациентов в больнице третьего уровня в Гуанчжоу, Китай, 2014–2016 гг. J Заражение Public Heal .2019; 12 (2): 252–257. DOI: 10.1016 / j.jiph.2018.10.012

27. Dong-ling L, Jie-hong W., Jing-song WU и др. Характеристики лекарственной устойчивости и молекулярное типирование сальмонеллы у пациентов с диареей из четырех больниц в Шэньчжэне. Зоонозы подбородка . 2017; 33 (10): 897–902. DOI: 10.3969 / j.issn.1002-2694.2017.10.009

28. Hopkins KL, Kirchner M, Guerra B, et al. Мультирезистентный серовар Salmonella enterica 4, [5], 12: i: -в европе: новый пандемический штамм? Euro Surveill .2010; 15 (22): 19580. DOI: 10.1016 / j.cmi.2016.07.033

29. Da-wei L, E-hong LJ, Ng-xiao JL, et al. Структура устойчивости к противомикробным препаратам и молекулярное типирование сальмонелл, выделенных в случаях диареи в Гуанчжоу. Современная профилактическая медицина . 2016; 43 (4).

30. Майкл Г.Б., Шварц С. Устойчивость к противомикробным препаратам зоонозных нетифоидных сальмонелл: тревожная тенденция? Clin Microbiol Infect . 2016; 22 (12): 968–974. DOI: 10.1016 / j.cmi.2016.07.033

31. Уэйн PA.Институт клинических и лабораторных стандартов. Выполните испытание на чувствительность к противомикробным препаратам на стойке . 2011.

32. Crump JA, Sjolund-Karlsson M, Gordon MA, Parry CM. Эпидемиология, клинические проявления, лабораторная диагностика, устойчивость к противомикробным препаратам и противомикробное лечение инвазивных инфекций сальмонеллы. Clin Microbiol Ред. . 2015; 28 (4): 901–937. DOI: 10.1128 / CMR.00002-15

33. Команда CEE. Опубликован совместный отчет ECDC / EFSA за 2013 г. о тенденциях и источниках зоонозов, зоонозных агентов и вспышек болезней пищевого происхождения. Евронаблюдение . 2015; 20 (4).

34. Mughini-Gras L, Enserink R, Friesema I, Heck M., van Duynhoven Y, van Pelt W. Факторы риска заражения человека сальмонеллезом от свиней, крупного рогатого скота, цыплят-бройлеров и кур-несушек: комбинированный контроль случая и источник атрибутивный анализ. PLoS One . 2014; 9 (2): e87933. DOI: 10.1371 / journal.pone.0087933

35. Jourdan-da SN, Fabre L, Robinson E, et al. Продолжающаяся общенациональная вспышка сальмонеллезной агоны, связанной с продуктами из грудного молока, распространяемыми по всему миру, Франция, декабрь 2017 г. Euro Surveill . 2018; 23 (2). DOI: 10.2807 / 1560-7917.ES.2018.23.2.17-00852

36. Джонс Дж., Пардос ДЛГМ, Эррера-Леон Л. и др. Вспышка сальмонеллы серотипа poona у младенцев, связанная со стойким заражением сальмонеллой на предприятии по производству детских смесей, Франция, август 2018 г. — февраль 2019 г. евро Surveill . 2019; 24 (13). DOI: 10.2807 / 1560-7917.ES.2019.24.13.1

1

37. Кэхилл С.М., Ваксмут И.К., Костаррика М.Л., Бен Э.П. Сухие детские смеси как источник инфекции сальмонеллы у младенцев. Clin Infect Dis . 2008. 46 (2): 268–273. DOI: 10.1086 / 524737

38. Ян Б., Чжао Х, Цуй С. и др. Распространенность и характеристика Salmonella enterica в сухом детском питании на основе молока в Шэньси, Китай. J Молочные науки . 2014. 97 (11): 6754–6760. DOI: 10.3168 / jds.2014-8292

39. Коппа Г.В., Фачинелли Б., Маги Г. и др. Гликозаминогликаны грудного молока ингибируют in vitro адгезию кишечной палочки и сальмонеллы fyris к клеткам кишечника человека. Педиатр Рес .2016; 79 (4): 603–607. DOI: 10.1038 / pr.2015.262

40. Лю Б., Ю З., Чен С., Клинг Д.Е., Ньюбург Д.С. Муцин 1 и муцин 4 грудного молока ингибируют инвазию Salmonella enterica serovar typhimurium в эпителиальные клетки кишечника человека in vitro. J Nutr . 2012. 142 (8): 1504–1509. DOI: 10.3945 / jn.111.155614

41. Гржибовски А.М., Косбаева А., Менне Б. Влияние температуры окружающего воздуха и осадков на ежемесячные подсчеты сальмонеллеза в четырех регионах Казахстана, Центральная Азия, в 2000–2010 гг. Эпидемиологическая инфекция . 2014. 142 (3): 608–615. DOI: 10.1017 / S095026881300157X

42. Ке Й, Лу В., Лю В., Чжу П., Чен К., Чжу З. Нетифоидные инфекции сальмонеллы среди детей в больнице третичного уровня в Нинбо, Чжэцзян, Китай, 2012–2019 гг. PLoS Negl Trop Dis . 2020; 14 (10): e0008732. DOI: 10.1371 / journal.pntd.0008732

43. Hung Y, Lay C, Wang C, Koo M. Характеристики нетифоидного сальмонеллезного гастроэнтерита у тайваньских детей: ретроспективный обзор истории болезни за 9 лет. J Заражение Public Heal . 2017; 10 (5): 518–521. DOI: 10.1016 / j.jiph.2016.09.018

44. Рен Л., Ян М., Гэн Л. и др. Нетифоидный сальмонеллезный гастроэнтерит в специализированной детской больнице на юге Китая: характеристики и диетические соображения. Гастроент Рес Прак . 2018; 2018: (1–4. Doi: 10.1155 / 2018/3097468

45. Ян Х, Джин К., Ян Ф и др. Нетифоидный сальмонеллезный гастроэнтерит в Баошане, Шанхай, Китай, 2010–2014 гг .: этиологическое наблюдение и исследование случай-контроль. J Food Prot . 2017; 80 (3): 482–487. DOI: 10.4315 / 0362-028X.JFP-16-309

46. Аоки Ю., Китадзава К., Кобаяши Н. и др. Клинические особенности детей с нетифоидной бактериемией, вызванной сальмонеллой: одно исследование в сельских районах Японии. PLoS One . 2017; 12 (6): e0176990. DOI: 10.1371 / journal.pone.0176990

47. Zhang S, Zhou Y, Tian L, et al. Устойчивость к антибиотикам и молекулярная характеристика диарейных штаммов Escherichia coli и нетифоидных сальмонелл, выделенных от инфекций в юго-западном Китае. Заражение бедностью . 2018; 7 (1). DOI: 10.1186 / s40249-018-0427-2

48. Мурасе Т., Ямада М., Муто Т., Мацусима А., Ямаи С. Фекальная экскреция salmonella enterica serovar typhimurium после пищевой вспышки. Дж. Клин Микробиол . 2000. 38 (9): 3495–3497. DOI: 10.1128 / JCM.38.9.3495-3497.2000

49. Бо Х, Вэй В, Чжи-син Ф., Цзин Ю. О статусе использования антибиотиков и прогрессе в выращивании без антибиотиков в птицеводстве. Индекс Пищи .2017; 38 (08): 216–220.

Клинико-эпидемиологические характеристики пациентов с коронавирусной болезнью 2019 (COVID-19)

Резюме

Общие сведения Многочисленные группы сообщили о клинических и эпидемиологических характеристиках случаев коронавирусной болезни 2019 (COVID-19); однако данные остались противоречивыми. Целью этого документа было объединить доступные данные, чтобы получить более полную картину характеристик пациентов с COVID-19.

Методы Был проведен систематический обзор и объединенный анализ.Соответствующие исследования были определены на основе базы данных и ручного поиска до 2 марта 2020 г. Данные о клинических (включая лабораторные и радиологические) и эпидемиологические (включая демографические) характеристики подтвержденных случаев COVID-19 были извлечены и объединены путем простого объединения.

Результаты Из 644 выявленных исследований 69 исследований (с участием 48 926 пациентов) были включены в анализ. Средний возраст пациентов составил 49,16 года. 51,46% пациентов составляли мужчины и 52 человека.32% были некурящими. Наиболее частыми сопутствующими заболеваниями были гипертония (50,82%) и диабет (20,89%). Наиболее частыми симптомами были лихорадка (83,21%), кашель (61,74%) и миалгия или усталость (30,22%). У части пациентов наблюдались измененные уровни крови и биохимические показатели. У большинства пациентов (78,50%) были двусторонние поражения легких, а у 5,86% не было обнаружено результатов КТ, указывающих на вирусную пневмонию. Синдром острого респираторного дистресс-синдрома (28,36%), острое повреждение сердца (7.89%) и острое повреждение почек (7,60%) были наиболее частыми зарегистрированными осложнениями.

Выводы Клинико-эпидемиологические характеристики пациентов с COVID-19 в основном неоднородны и неспецифичны. Это наиболее полный отчет о характеристиках пациентов с COVID-19 на сегодняшний день. Представленная информация важна для улучшения нашего понимания спектра и воздействия этого нового заболевания.

Заявление о конкурирующем интересе

Авторы заявили об отсутствии конкурирующего интереса.

Заявление о финансировании

Для этой работы не было получено финансирования

Заявления автора

Все соответствующие этические принципы были соблюдены; были получены все необходимые разрешения IRB и / или комитета по этике, а подробная информация об IRB / надзорном органе включена в рукопись.

Да

Получено все необходимое согласие пациента / участника и заархивированы соответствующие институциональные формы.

Да

Я понимаю, что все клинические испытания и любые другие проспективные интервенционные исследования должны быть зарегистрированы в одобренном ICMJE реестре, таком как ClinicalTrials.губ. Я подтверждаю, что любое такое исследование, указанное в рукописи, было зарегистрировано и предоставлен идентификатор регистрации исследования (примечание: при публикации проспективного исследования, зарегистрированного ретроспективно, просьба предоставить заявление в поле идентификатора исследования, объясняющее, почему исследование не было зарегистрировано заранее) .